Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTN0

LRFN3, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN3Q9BTN0 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRFN3Q9BTN0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRFN3Q9BTN0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRFN3Q9BTN0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRFN3Q9BTN0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRFN3Q9BTN0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRFN3Q9BTN0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRFN3Q9BTN0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRFN3Q9BTN0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRFN3Q9BTN0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRFN3Q9BTN0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRFN3Q9BTN0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRFN3Q9BTN0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRFN3Q9BTN0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRFN3Q9BTN0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LRFN3Q9BTN0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRFN3Q9BTN0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRFN3Q9BTN0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRFN3Q9BTN0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRFN3Q9BTN0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRFN3Q9BTN0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRFN3Q9BTN0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRFN3Q9BTN0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRFN3Q9BTN0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRFN3Q9BTN0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRFN3Q9BTN0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRFN3Q9BTN0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRFN3Q9BTN0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRFN3Q9BTN0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRFN3Q9BTN0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRFN3Q9BTN0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRFN3Q9BTN0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRFN3Q9BTN0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRFN3Q9BTN0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRFN3Q9BTN0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRFN3Q9BTN0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRFN3Q9BTN0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRFN3Q9BTN0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRFN3Q9BTN0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRFN3Q9BTN0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRFN3Q9BTN0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRFN3Q9BTN0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRFN3Q9BTN0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRFN3Q9BTN0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRFN3Q9BTN0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRFN3Q9BTN0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRFN3Q9BTN0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRFN3Q9BTN0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRFN3Q9BTN0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRFN3Q9BTN0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRFN3Q9BTN0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRFN3Q9BTN0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRFN3Q9BTN0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRFN3Q9BTN0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRFN3Q9BTN0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRFN3Q9BTN0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRFN3Q9BTN0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRFN3Q9BTN0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRFN3Q9BTN0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRFN3Q9BTN0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRFN3Q9BTN0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRFN3Q9BTN0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LRFN3Q9BTN0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRFN3Q9BTN0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRFN3Q9BTN0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRFN3Q9BTN0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRFN3Q9BTN0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRFN3Q9BTN0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LRFN3Q9BTN0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LRFN3Q9BTN0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRFN3Q9BTN0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRFN3Q9BTN0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRFN3Q9BTN0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRFN3Q9BTN0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LRFN3Q9BTN0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRFN3Q9BTN0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LRFN3Q9BTN0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRFN3Q9BTN0 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRFN3Q9BTN0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRFN3Q9BTN0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRFN3Q9BTN0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRFN3Q9BTN0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRFN3Q9BTN0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRFN3Q9BTN0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRFN3Q9BTN0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRFN3Q9BTN0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRFN3Q9BTN0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRFN3Q9BTN0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRFN3Q9BTN0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRFN3Q9BTN0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRFN3Q9BTN0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRFN3Q9BTN0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRFN3Q9BTN0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRFN3Q9BTN0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRFN3Q9BTN0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LRFN3Q9BTN0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRFN3Q9BTN0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRFN3Q9BTN0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LRFN3Q9BTN0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRFN3Q9BTN0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms