Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RBM42Q9BTD8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RBM42Q9BTD8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RBM42Q9BTD8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
RBM42Q9BTD8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RBM42Q9BTD8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RBM42Q9BTD8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
RBM42Q9BTD8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RBM42Q9BTD8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
RBM42Q9BTD8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
RBM42Q9BTD8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
RBM42Q9BTD8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
RBM42Q9BTD8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RBM42Q9BTD8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RBM42Q9BTD8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RBM42Q9BTD8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
RBM42Q9BTD8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RBM42Q9BTD8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RBM42Q9BTD8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
RBM42Q9BTD8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
RBM42Q9BTD8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
RBM42Q9BTD8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
RBM42Q9BTD8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
RBM42Q9BTD8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
RBM42Q9BTD8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
RBM42Q9BTD8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
RBM42Q9BTD8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
RBM42Q9BTD8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
RBM42Q9BTD8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
RBM42Q9BTD8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
RBM42Q9BTD8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
RBM42Q9BTD8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
RBM42Q9BTD8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
RBM42Q9BTD8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
RBM42Q9BTD8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
RBM42Q9BTD8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
RBM42Q9BTD8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
RBM42Q9BTD8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
RBM42Q9BTD8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
RBM42Q9BTD8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
RBM42Q9BTD8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
RBM42Q9BTD8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
RBM42Q9BTD8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
RBM42Q9BTD8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
RBM42Q9BTD8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
RBM42Q9BTD8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
RBM42Q9BTD8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
RBM42Q9BTD8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
RBM42Q9BTD8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
RBM42Q9BTD8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
RBM42Q9BTD8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
RBM42Q9BTD8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
RBM42Q9BTD8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
RBM42Q9BTD8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
RBM42Q9BTD8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
RBM42Q9BTD8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
RBM42Q9BTD8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
RBM42Q9BTD8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
RBM42Q9BTD8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
RBM42Q9BTD8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
RBM42Q9BTD8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
RBM42Q9BTD8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
RBM42Q9BTD8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
RBM42Q9BTD8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
RBM42Q9BTD8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
RBM42Q9BTD8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
RBM42Q9BTD8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
RBM42Q9BTD8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
RBM42Q9BTD8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
RBM42Q9BTD8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
RBM42Q9BTD8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
RBM42Q9BTD8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
RBM42Q9BTD8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
RBM42Q9BTD8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
RBM42Q9BTD8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
RBM42Q9BTD8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
RBM42Q9BTD8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
RBM42Q9BTD8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
RBM42Q9BTD8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC31.9■■■□□ 2.7
RBM42Q9BTD8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
RBM42Q9BTD8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
RBM42Q9BTD8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
RBM42Q9BTD8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
RBM42Q9BTD8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
RBM42Q9BTD8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
RBM42Q9BTD8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC31.88■■■□□ 2.69
RBM42Q9BTD8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
RBM42Q9BTD8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC31.87■■■□□ 2.69
RBM42Q9BTD8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
RBM42Q9BTD8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
RBM42Q9BTD8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
RBM42Q9BTD8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
RBM42Q9BTD8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
RBM42Q9BTD8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
RBM42Q9BTD8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
RBM42Q9BTD8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
RBM42Q9BTD8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
RBM42Q9BTD8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
RBM42Q9BTD8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
RBM42Q9BTD8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms