Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQT9

CLSTN3, Calsyntenin-3, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3Q9BQT9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLSTN3Q9BQT9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CLSTN3Q9BQT9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CLSTN3Q9BQT9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CLSTN3Q9BQT9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CLSTN3Q9BQT9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLSTN3Q9BQT9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLSTN3Q9BQT9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CLSTN3Q9BQT9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLSTN3Q9BQT9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CLSTN3Q9BQT9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLSTN3Q9BQT9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLSTN3Q9BQT9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLSTN3Q9BQT9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLSTN3Q9BQT9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CLSTN3Q9BQT9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLSTN3Q9BQT9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLSTN3Q9BQT9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLSTN3Q9BQT9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLSTN3Q9BQT9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLSTN3Q9BQT9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLSTN3Q9BQT9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLSTN3Q9BQT9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLSTN3Q9BQT9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CLSTN3Q9BQT9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLSTN3Q9BQT9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CLSTN3Q9BQT9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLSTN3Q9BQT9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLSTN3Q9BQT9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLSTN3Q9BQT9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLSTN3Q9BQT9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLSTN3Q9BQT9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLSTN3Q9BQT9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLSTN3Q9BQT9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CLSTN3Q9BQT9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLSTN3Q9BQT9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLSTN3Q9BQT9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLSTN3Q9BQT9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLSTN3Q9BQT9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLSTN3Q9BQT9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLSTN3Q9BQT9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLSTN3Q9BQT9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLSTN3Q9BQT9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLSTN3Q9BQT9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLSTN3Q9BQT9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLSTN3Q9BQT9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLSTN3Q9BQT9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CLSTN3Q9BQT9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLSTN3Q9BQT9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLSTN3Q9BQT9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLSTN3Q9BQT9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLSTN3Q9BQT9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLSTN3Q9BQT9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CLSTN3Q9BQT9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLSTN3Q9BQT9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLSTN3Q9BQT9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLSTN3Q9BQT9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLSTN3Q9BQT9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLSTN3Q9BQT9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLSTN3Q9BQT9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLSTN3Q9BQT9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLSTN3Q9BQT9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLSTN3Q9BQT9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CLSTN3Q9BQT9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLSTN3Q9BQT9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLSTN3Q9BQT9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLSTN3Q9BQT9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLSTN3Q9BQT9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLSTN3Q9BQT9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLSTN3Q9BQT9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLSTN3Q9BQT9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLSTN3Q9BQT9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLSTN3Q9BQT9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLSTN3Q9BQT9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CLSTN3Q9BQT9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLSTN3Q9BQT9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLSTN3Q9BQT9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLSTN3Q9BQT9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLSTN3Q9BQT9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLSTN3Q9BQT9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CLSTN3Q9BQT9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLSTN3Q9BQT9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CLSTN3Q9BQT9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLSTN3Q9BQT9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLSTN3Q9BQT9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLSTN3Q9BQT9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLSTN3Q9BQT9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CLSTN3Q9BQT9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CLSTN3Q9BQT9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLSTN3Q9BQT9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLSTN3Q9BQT9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLSTN3Q9BQT9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLSTN3Q9BQT9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLSTN3Q9BQT9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLSTN3Q9BQT9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLSTN3Q9BQT9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLSTN3Q9BQT9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLSTN3Q9BQT9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLSTN3Q9BQT9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLSTN3Q9BQT9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms