Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ7

RTP3, Receptor-transporting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP3Q9BQQ7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RTP3Q9BQQ7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RTP3Q9BQQ7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RTP3Q9BQQ7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RTP3Q9BQQ7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RTP3Q9BQQ7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RTP3Q9BQQ7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RTP3Q9BQQ7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RTP3Q9BQQ7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RTP3Q9BQQ7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RTP3Q9BQQ7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RTP3Q9BQQ7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RTP3Q9BQQ7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RTP3Q9BQQ7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RTP3Q9BQQ7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RTP3Q9BQQ7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RTP3Q9BQQ7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RTP3Q9BQQ7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RTP3Q9BQQ7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RTP3Q9BQQ7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RTP3Q9BQQ7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RTP3Q9BQQ7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RTP3Q9BQQ7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RTP3Q9BQQ7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RTP3Q9BQQ7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RTP3Q9BQQ7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RTP3Q9BQQ7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RTP3Q9BQQ7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RTP3Q9BQQ7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RTP3Q9BQQ7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RTP3Q9BQQ7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RTP3Q9BQQ7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RTP3Q9BQQ7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RTP3Q9BQQ7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RTP3Q9BQQ7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RTP3Q9BQQ7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RTP3Q9BQQ7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RTP3Q9BQQ7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RTP3Q9BQQ7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RTP3Q9BQQ7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RTP3Q9BQQ7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RTP3Q9BQQ7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RTP3Q9BQQ7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RTP3Q9BQQ7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RTP3Q9BQQ7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RTP3Q9BQQ7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RTP3Q9BQQ7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RTP3Q9BQQ7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RTP3Q9BQQ7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RTP3Q9BQQ7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RTP3Q9BQQ7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RTP3Q9BQQ7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RTP3Q9BQQ7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RTP3Q9BQQ7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RTP3Q9BQQ7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RTP3Q9BQQ7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RTP3Q9BQQ7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RTP3Q9BQQ7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RTP3Q9BQQ7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RTP3Q9BQQ7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RTP3Q9BQQ7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RTP3Q9BQQ7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RTP3Q9BQQ7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RTP3Q9BQQ7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RTP3Q9BQQ7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RTP3Q9BQQ7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RTP3Q9BQQ7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RTP3Q9BQQ7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RTP3Q9BQQ7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RTP3Q9BQQ7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTP3Q9BQQ7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTP3Q9BQQ7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTP3Q9BQQ7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTP3Q9BQQ7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTP3Q9BQQ7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTP3Q9BQQ7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RTP3Q9BQQ7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RTP3Q9BQQ7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RTP3Q9BQQ7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RTP3Q9BQQ7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RTP3Q9BQQ7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RTP3Q9BQQ7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RTP3Q9BQQ7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RTP3Q9BQQ7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RTP3Q9BQQ7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RTP3Q9BQQ7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RTP3Q9BQQ7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RTP3Q9BQQ7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RTP3Q9BQQ7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RTP3Q9BQQ7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.76
RTP3Q9BQQ7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RTP3Q9BQQ7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RTP3Q9BQQ7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RTP3Q9BQQ7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RTP3Q9BQQ7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RTP3Q9BQQ7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RTP3Q9BQQ7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RTP3Q9BQQ7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RTP3Q9BQQ7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RTP3Q9BQQ7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms