Protein–RNA interactions for Protein: Q96S06

LMF1, Lipase maturation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMF1Q96S06 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LMF1Q96S06 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMF1Q96S06 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LMF1Q96S06 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMF1Q96S06 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMF1Q96S06 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMF1Q96S06 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMF1Q96S06 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMF1Q96S06 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMF1Q96S06 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMF1Q96S06 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMF1Q96S06 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LMF1Q96S06 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMF1Q96S06 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMF1Q96S06 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LMF1Q96S06 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LMF1Q96S06 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMF1Q96S06 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMF1Q96S06 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMF1Q96S06 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMF1Q96S06 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LMF1Q96S06 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMF1Q96S06 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMF1Q96S06 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMF1Q96S06 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMF1Q96S06 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMF1Q96S06 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMF1Q96S06 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMF1Q96S06 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LMF1Q96S06 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMF1Q96S06 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMF1Q96S06 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMF1Q96S06 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMF1Q96S06 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMF1Q96S06 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMF1Q96S06 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMF1Q96S06 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMF1Q96S06 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMF1Q96S06 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMF1Q96S06 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMF1Q96S06 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMF1Q96S06 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMF1Q96S06 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LMF1Q96S06 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMF1Q96S06 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMF1Q96S06 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMF1Q96S06 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMF1Q96S06 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LMF1Q96S06 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMF1Q96S06 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LMF1Q96S06 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMF1Q96S06 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMF1Q96S06 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMF1Q96S06 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMF1Q96S06 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMF1Q96S06 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMF1Q96S06 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMF1Q96S06 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMF1Q96S06 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMF1Q96S06 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMF1Q96S06 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMF1Q96S06 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMF1Q96S06 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMF1Q96S06 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMF1Q96S06 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMF1Q96S06 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMF1Q96S06 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMF1Q96S06 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMF1Q96S06 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMF1Q96S06 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMF1Q96S06 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LMF1Q96S06 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LMF1Q96S06 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMF1Q96S06 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMF1Q96S06 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMF1Q96S06 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMF1Q96S06 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMF1Q96S06 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMF1Q96S06 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LMF1Q96S06 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMF1Q96S06 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMF1Q96S06 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMF1Q96S06 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMF1Q96S06 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LMF1Q96S06 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LMF1Q96S06 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMF1Q96S06 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMF1Q96S06 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMF1Q96S06 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LMF1Q96S06 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMF1Q96S06 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LMF1Q96S06 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMF1Q96S06 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMF1Q96S06 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMF1Q96S06 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMF1Q96S06 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMF1Q96S06 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMF1Q96S06 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMF1Q96S06 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMF1Q96S06 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms