Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ3

MCCC1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC1Q96RQ3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MCCC1Q96RQ3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCCC1Q96RQ3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCCC1Q96RQ3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCCC1Q96RQ3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCCC1Q96RQ3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCCC1Q96RQ3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCCC1Q96RQ3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MCCC1Q96RQ3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCCC1Q96RQ3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCCC1Q96RQ3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCCC1Q96RQ3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCCC1Q96RQ3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCCC1Q96RQ3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCCC1Q96RQ3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCCC1Q96RQ3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCCC1Q96RQ3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCCC1Q96RQ3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCCC1Q96RQ3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCCC1Q96RQ3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCCC1Q96RQ3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCCC1Q96RQ3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCCC1Q96RQ3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MCCC1Q96RQ3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCCC1Q96RQ3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCCC1Q96RQ3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCCC1Q96RQ3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCCC1Q96RQ3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCCC1Q96RQ3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCCC1Q96RQ3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCCC1Q96RQ3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MCCC1Q96RQ3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCCC1Q96RQ3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCCC1Q96RQ3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCCC1Q96RQ3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCCC1Q96RQ3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCCC1Q96RQ3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MCCC1Q96RQ3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCCC1Q96RQ3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MCCC1Q96RQ3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCCC1Q96RQ3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCCC1Q96RQ3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCCC1Q96RQ3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCCC1Q96RQ3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCCC1Q96RQ3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCCC1Q96RQ3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCCC1Q96RQ3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCCC1Q96RQ3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCCC1Q96RQ3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCCC1Q96RQ3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCCC1Q96RQ3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCCC1Q96RQ3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MCCC1Q96RQ3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCCC1Q96RQ3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCCC1Q96RQ3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCCC1Q96RQ3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCCC1Q96RQ3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCCC1Q96RQ3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCCC1Q96RQ3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCCC1Q96RQ3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCCC1Q96RQ3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCCC1Q96RQ3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCCC1Q96RQ3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCCC1Q96RQ3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MCCC1Q96RQ3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCCC1Q96RQ3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCCC1Q96RQ3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCCC1Q96RQ3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCCC1Q96RQ3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCCC1Q96RQ3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCCC1Q96RQ3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCCC1Q96RQ3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCCC1Q96RQ3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCCC1Q96RQ3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCCC1Q96RQ3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCCC1Q96RQ3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCCC1Q96RQ3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCCC1Q96RQ3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCCC1Q96RQ3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCCC1Q96RQ3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCCC1Q96RQ3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MCCC1Q96RQ3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCCC1Q96RQ3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCCC1Q96RQ3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCCC1Q96RQ3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCCC1Q96RQ3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCCC1Q96RQ3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCCC1Q96RQ3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MCCC1Q96RQ3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCCC1Q96RQ3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCCC1Q96RQ3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCCC1Q96RQ3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCCC1Q96RQ3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCCC1Q96RQ3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCCC1Q96RQ3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MCCC1Q96RQ3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MCCC1Q96RQ3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCCC1Q96RQ3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCCC1Q96RQ3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCCC1Q96RQ3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms