Protein–RNA interactions for Protein: Q96QU6

ACCS, 1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACCSQ96QU6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ACCSQ96QU6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ACCSQ96QU6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ACCSQ96QU6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ACCSQ96QU6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ACCSQ96QU6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ACCSQ96QU6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ACCSQ96QU6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ACCSQ96QU6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ACCSQ96QU6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ACCSQ96QU6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ACCSQ96QU6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ACCSQ96QU6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ACCSQ96QU6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ACCSQ96QU6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ACCSQ96QU6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ACCSQ96QU6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ACCSQ96QU6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ACCSQ96QU6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ACCSQ96QU6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ACCSQ96QU6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ACCSQ96QU6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ACCSQ96QU6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ACCSQ96QU6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ACCSQ96QU6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ACCSQ96QU6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ACCSQ96QU6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ACCSQ96QU6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ACCSQ96QU6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ACCSQ96QU6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ACCSQ96QU6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ACCSQ96QU6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ACCSQ96QU6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ACCSQ96QU6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ACCSQ96QU6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ACCSQ96QU6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ACCSQ96QU6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ACCSQ96QU6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ACCSQ96QU6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ACCSQ96QU6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ACCSQ96QU6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ACCSQ96QU6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ACCSQ96QU6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ACCSQ96QU6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ACCSQ96QU6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ACCSQ96QU6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ACCSQ96QU6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ACCSQ96QU6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ACCSQ96QU6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ACCSQ96QU6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ACCSQ96QU6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ACCSQ96QU6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ACCSQ96QU6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ACCSQ96QU6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ACCSQ96QU6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ACCSQ96QU6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ACCSQ96QU6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ACCSQ96QU6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ACCSQ96QU6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ACCSQ96QU6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ACCSQ96QU6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ACCSQ96QU6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ACCSQ96QU6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ACCSQ96QU6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ACCSQ96QU6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ACCSQ96QU6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ACCSQ96QU6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ACCSQ96QU6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ACCSQ96QU6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ACCSQ96QU6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ACCSQ96QU6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ACCSQ96QU6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ACCSQ96QU6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ACCSQ96QU6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ACCSQ96QU6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ACCSQ96QU6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ACCSQ96QU6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ACCSQ96QU6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ACCSQ96QU6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ACCSQ96QU6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ACCSQ96QU6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ACCSQ96QU6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ACCSQ96QU6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ACCSQ96QU6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ACCSQ96QU6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ACCSQ96QU6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ACCSQ96QU6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ACCSQ96QU6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ACCSQ96QU6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ACCSQ96QU6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ACCSQ96QU6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ACCSQ96QU6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ACCSQ96QU6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ACCSQ96QU6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ACCSQ96QU6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ACCSQ96QU6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ACCSQ96QU6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ACCSQ96QU6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ACCSQ96QU6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ACCSQ96QU6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms