Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV4

PNMA5, Paraneoplastic antigen-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA5Q96PV4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PNMA5Q96PV4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PNMA5Q96PV4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PNMA5Q96PV4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PNMA5Q96PV4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PNMA5Q96PV4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PNMA5Q96PV4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PNMA5Q96PV4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PNMA5Q96PV4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PNMA5Q96PV4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PNMA5Q96PV4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PNMA5Q96PV4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PNMA5Q96PV4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PNMA5Q96PV4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PNMA5Q96PV4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PNMA5Q96PV4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PNMA5Q96PV4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PNMA5Q96PV4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PNMA5Q96PV4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PNMA5Q96PV4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PNMA5Q96PV4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PNMA5Q96PV4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PNMA5Q96PV4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PNMA5Q96PV4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PNMA5Q96PV4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PNMA5Q96PV4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PNMA5Q96PV4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PNMA5Q96PV4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PNMA5Q96PV4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PNMA5Q96PV4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PNMA5Q96PV4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PNMA5Q96PV4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PNMA5Q96PV4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PNMA5Q96PV4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PNMA5Q96PV4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
PNMA5Q96PV4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
PNMA5Q96PV4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PNMA5Q96PV4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
PNMA5Q96PV4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PNMA5Q96PV4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PNMA5Q96PV4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PNMA5Q96PV4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PNMA5Q96PV4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PNMA5Q96PV4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PNMA5Q96PV4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PNMA5Q96PV4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PNMA5Q96PV4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PNMA5Q96PV4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PNMA5Q96PV4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PNMA5Q96PV4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PNMA5Q96PV4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PNMA5Q96PV4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PNMA5Q96PV4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PNMA5Q96PV4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PNMA5Q96PV4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PNMA5Q96PV4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PNMA5Q96PV4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PNMA5Q96PV4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PNMA5Q96PV4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PNMA5Q96PV4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PNMA5Q96PV4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PNMA5Q96PV4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PNMA5Q96PV4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PNMA5Q96PV4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PNMA5Q96PV4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PNMA5Q96PV4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PNMA5Q96PV4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PNMA5Q96PV4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PNMA5Q96PV4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PNMA5Q96PV4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PNMA5Q96PV4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PNMA5Q96PV4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PNMA5Q96PV4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PNMA5Q96PV4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PNMA5Q96PV4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PNMA5Q96PV4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PNMA5Q96PV4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PNMA5Q96PV4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PNMA5Q96PV4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PNMA5Q96PV4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PNMA5Q96PV4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PNMA5Q96PV4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PNMA5Q96PV4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PNMA5Q96PV4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PNMA5Q96PV4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PNMA5Q96PV4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PNMA5Q96PV4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PNMA5Q96PV4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PNMA5Q96PV4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PNMA5Q96PV4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PNMA5Q96PV4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PNMA5Q96PV4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PNMA5Q96PV4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PNMA5Q96PV4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PNMA5Q96PV4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PNMA5Q96PV4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PNMA5Q96PV4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PNMA5Q96PV4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PNMA5Q96PV4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PNMA5Q96PV4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1146.2 ms