Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA2

RILP, Rab-interacting lysosomal protein, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RILPQ96NA2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RILPQ96NA2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RILPQ96NA2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RILPQ96NA2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RILPQ96NA2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RILPQ96NA2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RILPQ96NA2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RILPQ96NA2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RILPQ96NA2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RILPQ96NA2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RILPQ96NA2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RILPQ96NA2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RILPQ96NA2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RILPQ96NA2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RILPQ96NA2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RILPQ96NA2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RILPQ96NA2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RILPQ96NA2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RILPQ96NA2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RILPQ96NA2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RILPQ96NA2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RILPQ96NA2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RILPQ96NA2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RILPQ96NA2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RILPQ96NA2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RILPQ96NA2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RILPQ96NA2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RILPQ96NA2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RILPQ96NA2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RILPQ96NA2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RILPQ96NA2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RILPQ96NA2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RILPQ96NA2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RILPQ96NA2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RILPQ96NA2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RILPQ96NA2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RILPQ96NA2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RILPQ96NA2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RILPQ96NA2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RILPQ96NA2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RILPQ96NA2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RILPQ96NA2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RILPQ96NA2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RILPQ96NA2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RILPQ96NA2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RILPQ96NA2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RILPQ96NA2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RILPQ96NA2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RILPQ96NA2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RILPQ96NA2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RILPQ96NA2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RILPQ96NA2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RILPQ96NA2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RILPQ96NA2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RILPQ96NA2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RILPQ96NA2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RILPQ96NA2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RILPQ96NA2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RILPQ96NA2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RILPQ96NA2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RILPQ96NA2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RILPQ96NA2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RILPQ96NA2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RILPQ96NA2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RILPQ96NA2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RILPQ96NA2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RILPQ96NA2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RILPQ96NA2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RILPQ96NA2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RILPQ96NA2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RILPQ96NA2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RILPQ96NA2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RILPQ96NA2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RILPQ96NA2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RILPQ96NA2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RILPQ96NA2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RILPQ96NA2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RILPQ96NA2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RILPQ96NA2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RILPQ96NA2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RILPQ96NA2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RILPQ96NA2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RILPQ96NA2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RILPQ96NA2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RILPQ96NA2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RILPQ96NA2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RILPQ96NA2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RILPQ96NA2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RILPQ96NA2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RILPQ96NA2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RILPQ96NA2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RILPQ96NA2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RILPQ96NA2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RILPQ96NA2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RILPQ96NA2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RILPQ96NA2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RILPQ96NA2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RILPQ96NA2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RILPQ96NA2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RILPQ96NA2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms