Protein–RNA interactions for Protein: Q96N28

PRELID3A, PRELI domain containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3AQ96N28 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRELID3AQ96N28 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRELID3AQ96N28 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRELID3AQ96N28 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRELID3AQ96N28 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRELID3AQ96N28 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRELID3AQ96N28 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRELID3AQ96N28 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRELID3AQ96N28 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRELID3AQ96N28 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRELID3AQ96N28 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRELID3AQ96N28 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRELID3AQ96N28 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRELID3AQ96N28 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRELID3AQ96N28 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRELID3AQ96N28 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRELID3AQ96N28 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRELID3AQ96N28 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRELID3AQ96N28 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRELID3AQ96N28 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRELID3AQ96N28 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRELID3AQ96N28 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRELID3AQ96N28 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRELID3AQ96N28 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRELID3AQ96N28 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRELID3AQ96N28 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRELID3AQ96N28 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRELID3AQ96N28 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PRELID3AQ96N28 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRELID3AQ96N28 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRELID3AQ96N28 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRELID3AQ96N28 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PRELID3AQ96N28 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRELID3AQ96N28 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRELID3AQ96N28 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRELID3AQ96N28 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRELID3AQ96N28 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRELID3AQ96N28 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRELID3AQ96N28 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRELID3AQ96N28 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRELID3AQ96N28 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRELID3AQ96N28 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRELID3AQ96N28 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRELID3AQ96N28 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRELID3AQ96N28 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRELID3AQ96N28 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRELID3AQ96N28 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRELID3AQ96N28 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRELID3AQ96N28 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRELID3AQ96N28 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRELID3AQ96N28 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRELID3AQ96N28 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
PRELID3AQ96N28 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRELID3AQ96N28 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRELID3AQ96N28 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRELID3AQ96N28 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRELID3AQ96N28 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRELID3AQ96N28 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRELID3AQ96N28 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRELID3AQ96N28 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRELID3AQ96N28 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRELID3AQ96N28 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PRELID3AQ96N28 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRELID3AQ96N28 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRELID3AQ96N28 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRELID3AQ96N28 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRELID3AQ96N28 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRELID3AQ96N28 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRELID3AQ96N28 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRELID3AQ96N28 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRELID3AQ96N28 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRELID3AQ96N28 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRELID3AQ96N28 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PRELID3AQ96N28 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRELID3AQ96N28 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRELID3AQ96N28 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRELID3AQ96N28 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRELID3AQ96N28 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRELID3AQ96N28 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRELID3AQ96N28 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRELID3AQ96N28 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRELID3AQ96N28 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRELID3AQ96N28 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRELID3AQ96N28 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRELID3AQ96N28 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRELID3AQ96N28 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRELID3AQ96N28 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRELID3AQ96N28 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRELID3AQ96N28 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRELID3AQ96N28 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRELID3AQ96N28 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRELID3AQ96N28 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRELID3AQ96N28 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRELID3AQ96N28 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRELID3AQ96N28 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRELID3AQ96N28 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PRELID3AQ96N28 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRELID3AQ96N28 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRELID3AQ96N28 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRELID3AQ96N28 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms