Protein–RNA interactions for Protein: Q96N03

VSTM2L, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2LQ96N03 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VSTM2LQ96N03 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VSTM2LQ96N03 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VSTM2LQ96N03 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VSTM2LQ96N03 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VSTM2LQ96N03 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VSTM2LQ96N03 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VSTM2LQ96N03 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VSTM2LQ96N03 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VSTM2LQ96N03 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VSTM2LQ96N03 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
VSTM2LQ96N03 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VSTM2LQ96N03 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VSTM2LQ96N03 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VSTM2LQ96N03 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VSTM2LQ96N03 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VSTM2LQ96N03 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VSTM2LQ96N03 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VSTM2LQ96N03 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VSTM2LQ96N03 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VSTM2LQ96N03 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VSTM2LQ96N03 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VSTM2LQ96N03 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VSTM2LQ96N03 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VSTM2LQ96N03 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VSTM2LQ96N03 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VSTM2LQ96N03 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VSTM2LQ96N03 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VSTM2LQ96N03 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VSTM2LQ96N03 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VSTM2LQ96N03 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VSTM2LQ96N03 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VSTM2LQ96N03 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSTM2LQ96N03 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSTM2LQ96N03 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSTM2LQ96N03 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSTM2LQ96N03 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSTM2LQ96N03 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VSTM2LQ96N03 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VSTM2LQ96N03 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VSTM2LQ96N03 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VSTM2LQ96N03 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VSTM2LQ96N03 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VSTM2LQ96N03 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VSTM2LQ96N03 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VSTM2LQ96N03 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VSTM2LQ96N03 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VSTM2LQ96N03 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VSTM2LQ96N03 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VSTM2LQ96N03 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VSTM2LQ96N03 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VSTM2LQ96N03 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VSTM2LQ96N03 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VSTM2LQ96N03 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VSTM2LQ96N03 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VSTM2LQ96N03 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VSTM2LQ96N03 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VSTM2LQ96N03 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
VSTM2LQ96N03 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VSTM2LQ96N03 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VSTM2LQ96N03 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VSTM2LQ96N03 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VSTM2LQ96N03 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSTM2LQ96N03 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSTM2LQ96N03 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSTM2LQ96N03 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSTM2LQ96N03 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
VSTM2LQ96N03 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSTM2LQ96N03 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSTM2LQ96N03 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VSTM2LQ96N03 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VSTM2LQ96N03 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VSTM2LQ96N03 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VSTM2LQ96N03 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VSTM2LQ96N03 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VSTM2LQ96N03 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VSTM2LQ96N03 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VSTM2LQ96N03 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VSTM2LQ96N03 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VSTM2LQ96N03 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VSTM2LQ96N03 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VSTM2LQ96N03 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VSTM2LQ96N03 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VSTM2LQ96N03 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VSTM2LQ96N03 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VSTM2LQ96N03 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VSTM2LQ96N03 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VSTM2LQ96N03 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VSTM2LQ96N03 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
VSTM2LQ96N03 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VSTM2LQ96N03 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VSTM2LQ96N03 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VSTM2LQ96N03 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VSTM2LQ96N03 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VSTM2LQ96N03 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VSTM2LQ96N03 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VSTM2LQ96N03 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VSTM2LQ96N03 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VSTM2LQ96N03 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VSTM2LQ96N03 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms