Protein–RNA interactions for Protein: Q96KP6

TNIP3, TNFAIP3-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP3Q96KP6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNIP3Q96KP6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TNIP3Q96KP6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNIP3Q96KP6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNIP3Q96KP6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNIP3Q96KP6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNIP3Q96KP6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNIP3Q96KP6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNIP3Q96KP6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNIP3Q96KP6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNIP3Q96KP6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TNIP3Q96KP6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNIP3Q96KP6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNIP3Q96KP6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TNIP3Q96KP6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNIP3Q96KP6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNIP3Q96KP6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNIP3Q96KP6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNIP3Q96KP6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNIP3Q96KP6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNIP3Q96KP6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNIP3Q96KP6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNIP3Q96KP6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNIP3Q96KP6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNIP3Q96KP6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNIP3Q96KP6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNIP3Q96KP6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNIP3Q96KP6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNIP3Q96KP6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNIP3Q96KP6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNIP3Q96KP6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNIP3Q96KP6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNIP3Q96KP6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNIP3Q96KP6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNIP3Q96KP6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNIP3Q96KP6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNIP3Q96KP6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNIP3Q96KP6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNIP3Q96KP6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNIP3Q96KP6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNIP3Q96KP6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNIP3Q96KP6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNIP3Q96KP6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNIP3Q96KP6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TNIP3Q96KP6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNIP3Q96KP6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNIP3Q96KP6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNIP3Q96KP6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNIP3Q96KP6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNIP3Q96KP6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNIP3Q96KP6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNIP3Q96KP6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNIP3Q96KP6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TNIP3Q96KP6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNIP3Q96KP6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNIP3Q96KP6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNIP3Q96KP6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNIP3Q96KP6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNIP3Q96KP6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNIP3Q96KP6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNIP3Q96KP6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNIP3Q96KP6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNIP3Q96KP6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNIP3Q96KP6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNIP3Q96KP6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNIP3Q96KP6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNIP3Q96KP6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNIP3Q96KP6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TNIP3Q96KP6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TNIP3Q96KP6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNIP3Q96KP6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TNIP3Q96KP6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TNIP3Q96KP6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNIP3Q96KP6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNIP3Q96KP6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TNIP3Q96KP6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNIP3Q96KP6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNIP3Q96KP6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNIP3Q96KP6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNIP3Q96KP6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNIP3Q96KP6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TNIP3Q96KP6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNIP3Q96KP6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNIP3Q96KP6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNIP3Q96KP6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNIP3Q96KP6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNIP3Q96KP6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNIP3Q96KP6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNIP3Q96KP6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNIP3Q96KP6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNIP3Q96KP6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNIP3Q96KP6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNIP3Q96KP6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNIP3Q96KP6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TNIP3Q96KP6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNIP3Q96KP6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TNIP3Q96KP6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNIP3Q96KP6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TNIP3Q96KP6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TNIP3Q96KP6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms