Protein–RNA interactions for Protein: Q96K37

SLC35E1, Solute carrier family 35 member E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35E1Q96K37 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLC35E1Q96K37 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLC35E1Q96K37 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLC35E1Q96K37 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SLC35E1Q96K37 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SLC35E1Q96K37 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SLC35E1Q96K37 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SLC35E1Q96K37 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SLC35E1Q96K37 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SLC35E1Q96K37 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SLC35E1Q96K37 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SLC35E1Q96K37 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SLC35E1Q96K37 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SLC35E1Q96K37 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SLC35E1Q96K37 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SLC35E1Q96K37 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SLC35E1Q96K37 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SLC35E1Q96K37 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SLC35E1Q96K37 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SLC35E1Q96K37 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SLC35E1Q96K37 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SLC35E1Q96K37 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SLC35E1Q96K37 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SLC35E1Q96K37 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SLC35E1Q96K37 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SLC35E1Q96K37 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SLC35E1Q96K37 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SLC35E1Q96K37 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SLC35E1Q96K37 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SLC35E1Q96K37 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC35E1Q96K37 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC35E1Q96K37 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC35E1Q96K37 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC35E1Q96K37 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC35E1Q96K37 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC35E1Q96K37 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SLC35E1Q96K37 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC35E1Q96K37 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC35E1Q96K37 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC35E1Q96K37 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC35E1Q96K37 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC35E1Q96K37 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC35E1Q96K37 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC35E1Q96K37 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC35E1Q96K37 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC35E1Q96K37 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC35E1Q96K37 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC35E1Q96K37 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC35E1Q96K37 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC35E1Q96K37 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC35E1Q96K37 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC35E1Q96K37 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC35E1Q96K37 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC35E1Q96K37 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC35E1Q96K37 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC35E1Q96K37 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC35E1Q96K37 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC35E1Q96K37 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC35E1Q96K37 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC35E1Q96K37 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC35E1Q96K37 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC35E1Q96K37 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC35E1Q96K37 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC35E1Q96K37 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC35E1Q96K37 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC35E1Q96K37 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC35E1Q96K37 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC35E1Q96K37 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC35E1Q96K37 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC35E1Q96K37 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC35E1Q96K37 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC35E1Q96K37 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC35E1Q96K37 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC35E1Q96K37 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC35E1Q96K37 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC35E1Q96K37 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC35E1Q96K37 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC35E1Q96K37 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC35E1Q96K37 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC35E1Q96K37 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC35E1Q96K37 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC35E1Q96K37 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC35E1Q96K37 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC35E1Q96K37 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC35E1Q96K37 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC35E1Q96K37 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC35E1Q96K37 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC35E1Q96K37 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC35E1Q96K37 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC35E1Q96K37 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC35E1Q96K37 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC35E1Q96K37 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC35E1Q96K37 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC35E1Q96K37 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC35E1Q96K37 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC35E1Q96K37 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC35E1Q96K37 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC35E1Q96K37 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC35E1Q96K37 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC35E1Q96K37 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms