Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN0

LCOR, Ligand-dependent corepressor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCORQ96JN0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LCORQ96JN0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCORQ96JN0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCORQ96JN0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCORQ96JN0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCORQ96JN0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LCORQ96JN0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCORQ96JN0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LCORQ96JN0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LCORQ96JN0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LCORQ96JN0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LCORQ96JN0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCORQ96JN0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCORQ96JN0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCORQ96JN0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCORQ96JN0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LCORQ96JN0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCORQ96JN0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCORQ96JN0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LCORQ96JN0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LCORQ96JN0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCORQ96JN0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCORQ96JN0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCORQ96JN0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCORQ96JN0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCORQ96JN0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCORQ96JN0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCORQ96JN0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCORQ96JN0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCORQ96JN0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCORQ96JN0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCORQ96JN0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCORQ96JN0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LCORQ96JN0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCORQ96JN0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCORQ96JN0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCORQ96JN0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCORQ96JN0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCORQ96JN0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCORQ96JN0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCORQ96JN0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCORQ96JN0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCORQ96JN0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCORQ96JN0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LCORQ96JN0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCORQ96JN0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LCORQ96JN0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCORQ96JN0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCORQ96JN0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCORQ96JN0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCORQ96JN0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LCORQ96JN0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCORQ96JN0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCORQ96JN0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCORQ96JN0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCORQ96JN0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCORQ96JN0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LCORQ96JN0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCORQ96JN0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LCORQ96JN0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCORQ96JN0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCORQ96JN0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCORQ96JN0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCORQ96JN0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCORQ96JN0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCORQ96JN0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCORQ96JN0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCORQ96JN0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCORQ96JN0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCORQ96JN0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCORQ96JN0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCORQ96JN0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCORQ96JN0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCORQ96JN0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCORQ96JN0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCORQ96JN0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCORQ96JN0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCORQ96JN0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCORQ96JN0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCORQ96JN0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCORQ96JN0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCORQ96JN0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCORQ96JN0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LCORQ96JN0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LCORQ96JN0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LCORQ96JN0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LCORQ96JN0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LCORQ96JN0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCORQ96JN0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCORQ96JN0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCORQ96JN0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LCORQ96JN0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCORQ96JN0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCORQ96JN0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCORQ96JN0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCORQ96JN0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCORQ96JN0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCORQ96JN0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCORQ96JN0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCORQ96JN0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms