Protein–RNA interactions for Protein: Q96JK4

HHIPL1, HHIP-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPL1Q96JK4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HHIPL1Q96JK4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HHIPL1Q96JK4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HHIPL1Q96JK4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HHIPL1Q96JK4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HHIPL1Q96JK4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
HHIPL1Q96JK4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HHIPL1Q96JK4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HHIPL1Q96JK4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HHIPL1Q96JK4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HHIPL1Q96JK4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HHIPL1Q96JK4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
HHIPL1Q96JK4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HHIPL1Q96JK4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HHIPL1Q96JK4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HHIPL1Q96JK4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HHIPL1Q96JK4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
HHIPL1Q96JK4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HHIPL1Q96JK4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HHIPL1Q96JK4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HHIPL1Q96JK4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HHIPL1Q96JK4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HHIPL1Q96JK4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HHIPL1Q96JK4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HHIPL1Q96JK4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
HHIPL1Q96JK4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HHIPL1Q96JK4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HHIPL1Q96JK4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
HHIPL1Q96JK4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HHIPL1Q96JK4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HHIPL1Q96JK4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HHIPL1Q96JK4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HHIPL1Q96JK4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HHIPL1Q96JK4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HHIPL1Q96JK4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HHIPL1Q96JK4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
HHIPL1Q96JK4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
HHIPL1Q96JK4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HHIPL1Q96JK4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HHIPL1Q96JK4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HHIPL1Q96JK4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HHIPL1Q96JK4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HHIPL1Q96JK4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HHIPL1Q96JK4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HHIPL1Q96JK4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HHIPL1Q96JK4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HHIPL1Q96JK4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HHIPL1Q96JK4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HHIPL1Q96JK4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HHIPL1Q96JK4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HHIPL1Q96JK4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HHIPL1Q96JK4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HHIPL1Q96JK4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HHIPL1Q96JK4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HHIPL1Q96JK4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HHIPL1Q96JK4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HHIPL1Q96JK4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HHIPL1Q96JK4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HHIPL1Q96JK4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HHIPL1Q96JK4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HHIPL1Q96JK4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HHIPL1Q96JK4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HHIPL1Q96JK4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HHIPL1Q96JK4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HHIPL1Q96JK4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HHIPL1Q96JK4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HHIPL1Q96JK4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HHIPL1Q96JK4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HHIPL1Q96JK4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
HHIPL1Q96JK4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HHIPL1Q96JK4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HHIPL1Q96JK4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HHIPL1Q96JK4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HHIPL1Q96JK4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HHIPL1Q96JK4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HHIPL1Q96JK4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
HHIPL1Q96JK4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HHIPL1Q96JK4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HHIPL1Q96JK4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HHIPL1Q96JK4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HHIPL1Q96JK4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HHIPL1Q96JK4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
HHIPL1Q96JK4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
HHIPL1Q96JK4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
HHIPL1Q96JK4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HHIPL1Q96JK4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HHIPL1Q96JK4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HHIPL1Q96JK4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
HHIPL1Q96JK4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HHIPL1Q96JK4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HHIPL1Q96JK4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HHIPL1Q96JK4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HHIPL1Q96JK4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HHIPL1Q96JK4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
HHIPL1Q96JK4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HHIPL1Q96JK4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HHIPL1Q96JK4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HHIPL1Q96JK4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HHIPL1Q96JK4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HHIPL1Q96JK4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms