Protein–RNA interactions for Protein: Q96G28

CFAP36, Cilia- and flagella-associated protein 36, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP36Q96G28 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP36Q96G28 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP36Q96G28 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP36Q96G28 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP36Q96G28 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP36Q96G28 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP36Q96G28 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP36Q96G28 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP36Q96G28 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP36Q96G28 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFAP36Q96G28 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFAP36Q96G28 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFAP36Q96G28 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFAP36Q96G28 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFAP36Q96G28 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFAP36Q96G28 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFAP36Q96G28 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CFAP36Q96G28 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CFAP36Q96G28 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CFAP36Q96G28 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP36Q96G28 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP36Q96G28 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP36Q96G28 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP36Q96G28 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP36Q96G28 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP36Q96G28 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP36Q96G28 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP36Q96G28 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP36Q96G28 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP36Q96G28 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP36Q96G28 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP36Q96G28 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP36Q96G28 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP36Q96G28 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP36Q96G28 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP36Q96G28 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP36Q96G28 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP36Q96G28 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP36Q96G28 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP36Q96G28 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP36Q96G28 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP36Q96G28 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP36Q96G28 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP36Q96G28 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP36Q96G28 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP36Q96G28 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP36Q96G28 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP36Q96G28 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP36Q96G28 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP36Q96G28 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP36Q96G28 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP36Q96G28 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP36Q96G28 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP36Q96G28 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP36Q96G28 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP36Q96G28 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP36Q96G28 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP36Q96G28 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP36Q96G28 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP36Q96G28 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP36Q96G28 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP36Q96G28 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP36Q96G28 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP36Q96G28 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP36Q96G28 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP36Q96G28 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP36Q96G28 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP36Q96G28 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP36Q96G28 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP36Q96G28 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP36Q96G28 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP36Q96G28 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP36Q96G28 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP36Q96G28 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP36Q96G28 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP36Q96G28 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP36Q96G28 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP36Q96G28 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP36Q96G28 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP36Q96G28 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP36Q96G28 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP36Q96G28 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP36Q96G28 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP36Q96G28 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP36Q96G28 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP36Q96G28 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP36Q96G28 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP36Q96G28 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP36Q96G28 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP36Q96G28 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CFAP36Q96G28 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CFAP36Q96G28 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CFAP36Q96G28 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CFAP36Q96G28 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CFAP36Q96G28 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CFAP36Q96G28 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CFAP36Q96G28 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CFAP36Q96G28 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CFAP36Q96G28 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CFAP36Q96G28 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182 ms