Protein–RNA interactions for Protein: Q96D71

REPS1, RalBP1-associated Eps domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPS1Q96D71 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
REPS1Q96D71 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
REPS1Q96D71 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
REPS1Q96D71 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
REPS1Q96D71 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
REPS1Q96D71 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
REPS1Q96D71 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
REPS1Q96D71 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
REPS1Q96D71 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
REPS1Q96D71 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
REPS1Q96D71 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
REPS1Q96D71 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
REPS1Q96D71 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
REPS1Q96D71 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
REPS1Q96D71 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
REPS1Q96D71 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
REPS1Q96D71 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
REPS1Q96D71 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
REPS1Q96D71 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
REPS1Q96D71 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
REPS1Q96D71 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
REPS1Q96D71 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
REPS1Q96D71 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
REPS1Q96D71 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
REPS1Q96D71 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
REPS1Q96D71 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
REPS1Q96D71 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
REPS1Q96D71 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
REPS1Q96D71 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
REPS1Q96D71 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
REPS1Q96D71 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
REPS1Q96D71 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
REPS1Q96D71 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
REPS1Q96D71 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
REPS1Q96D71 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
REPS1Q96D71 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
REPS1Q96D71 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
REPS1Q96D71 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
REPS1Q96D71 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
REPS1Q96D71 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
REPS1Q96D71 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
REPS1Q96D71 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
REPS1Q96D71 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
REPS1Q96D71 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
REPS1Q96D71 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
REPS1Q96D71 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
REPS1Q96D71 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
REPS1Q96D71 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
REPS1Q96D71 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
REPS1Q96D71 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
REPS1Q96D71 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
REPS1Q96D71 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
REPS1Q96D71 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
REPS1Q96D71 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
REPS1Q96D71 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
REPS1Q96D71 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
REPS1Q96D71 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
REPS1Q96D71 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
REPS1Q96D71 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
REPS1Q96D71 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
REPS1Q96D71 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
REPS1Q96D71 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
REPS1Q96D71 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
REPS1Q96D71 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
REPS1Q96D71 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
REPS1Q96D71 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
REPS1Q96D71 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
REPS1Q96D71 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
REPS1Q96D71 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
REPS1Q96D71 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
REPS1Q96D71 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
REPS1Q96D71 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
REPS1Q96D71 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
REPS1Q96D71 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
REPS1Q96D71 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
REPS1Q96D71 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
REPS1Q96D71 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
REPS1Q96D71 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
REPS1Q96D71 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
REPS1Q96D71 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
REPS1Q96D71 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
REPS1Q96D71 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
REPS1Q96D71 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
REPS1Q96D71 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
REPS1Q96D71 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
REPS1Q96D71 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
REPS1Q96D71 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
REPS1Q96D71 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
REPS1Q96D71 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
REPS1Q96D71 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
REPS1Q96D71 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
REPS1Q96D71 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
REPS1Q96D71 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
REPS1Q96D71 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
REPS1Q96D71 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
REPS1Q96D71 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
REPS1Q96D71 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
REPS1Q96D71 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
REPS1Q96D71 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
REPS1Q96D71 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms