Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG8

CTHRC1, Collagen triple helix repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTHRC1Q96CG8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTHRC1Q96CG8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CTHRC1Q96CG8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTHRC1Q96CG8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTHRC1Q96CG8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTHRC1Q96CG8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTHRC1Q96CG8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTHRC1Q96CG8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTHRC1Q96CG8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTHRC1Q96CG8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CTHRC1Q96CG8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTHRC1Q96CG8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTHRC1Q96CG8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTHRC1Q96CG8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTHRC1Q96CG8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CTHRC1Q96CG8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTHRC1Q96CG8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTHRC1Q96CG8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTHRC1Q96CG8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTHRC1Q96CG8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTHRC1Q96CG8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTHRC1Q96CG8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTHRC1Q96CG8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTHRC1Q96CG8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTHRC1Q96CG8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTHRC1Q96CG8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTHRC1Q96CG8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTHRC1Q96CG8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTHRC1Q96CG8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTHRC1Q96CG8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTHRC1Q96CG8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTHRC1Q96CG8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTHRC1Q96CG8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTHRC1Q96CG8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTHRC1Q96CG8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTHRC1Q96CG8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTHRC1Q96CG8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTHRC1Q96CG8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTHRC1Q96CG8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTHRC1Q96CG8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTHRC1Q96CG8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTHRC1Q96CG8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTHRC1Q96CG8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTHRC1Q96CG8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTHRC1Q96CG8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTHRC1Q96CG8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTHRC1Q96CG8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTHRC1Q96CG8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTHRC1Q96CG8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTHRC1Q96CG8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CTHRC1Q96CG8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTHRC1Q96CG8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTHRC1Q96CG8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTHRC1Q96CG8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTHRC1Q96CG8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTHRC1Q96CG8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CTHRC1Q96CG8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CTHRC1Q96CG8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTHRC1Q96CG8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTHRC1Q96CG8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTHRC1Q96CG8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTHRC1Q96CG8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTHRC1Q96CG8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTHRC1Q96CG8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTHRC1Q96CG8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CTHRC1Q96CG8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTHRC1Q96CG8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTHRC1Q96CG8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTHRC1Q96CG8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTHRC1Q96CG8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTHRC1Q96CG8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTHRC1Q96CG8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTHRC1Q96CG8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTHRC1Q96CG8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTHRC1Q96CG8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTHRC1Q96CG8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTHRC1Q96CG8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTHRC1Q96CG8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTHRC1Q96CG8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTHRC1Q96CG8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTHRC1Q96CG8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTHRC1Q96CG8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTHRC1Q96CG8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTHRC1Q96CG8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTHRC1Q96CG8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTHRC1Q96CG8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTHRC1Q96CG8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CTHRC1Q96CG8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTHRC1Q96CG8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTHRC1Q96CG8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTHRC1Q96CG8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTHRC1Q96CG8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTHRC1Q96CG8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTHRC1Q96CG8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTHRC1Q96CG8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTHRC1Q96CG8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTHRC1Q96CG8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTHRC1Q96CG8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTHRC1Q96CG8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTHRC1Q96CG8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms