Protein–RNA interactions for Protein: Q96C92

SDCCAG3, Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3Q96C92 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDCCAG3Q96C92 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDCCAG3Q96C92 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDCCAG3Q96C92 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDCCAG3Q96C92 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDCCAG3Q96C92 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDCCAG3Q96C92 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDCCAG3Q96C92 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDCCAG3Q96C92 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDCCAG3Q96C92 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDCCAG3Q96C92 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDCCAG3Q96C92 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SDCCAG3Q96C92 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SDCCAG3Q96C92 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SDCCAG3Q96C92 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SDCCAG3Q96C92 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDCCAG3Q96C92 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDCCAG3Q96C92 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDCCAG3Q96C92 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDCCAG3Q96C92 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDCCAG3Q96C92 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDCCAG3Q96C92 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDCCAG3Q96C92 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDCCAG3Q96C92 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDCCAG3Q96C92 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDCCAG3Q96C92 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDCCAG3Q96C92 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SDCCAG3Q96C92 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDCCAG3Q96C92 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDCCAG3Q96C92 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDCCAG3Q96C92 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDCCAG3Q96C92 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDCCAG3Q96C92 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDCCAG3Q96C92 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDCCAG3Q96C92 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDCCAG3Q96C92 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDCCAG3Q96C92 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDCCAG3Q96C92 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDCCAG3Q96C92 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDCCAG3Q96C92 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDCCAG3Q96C92 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDCCAG3Q96C92 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDCCAG3Q96C92 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDCCAG3Q96C92 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDCCAG3Q96C92 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDCCAG3Q96C92 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDCCAG3Q96C92 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDCCAG3Q96C92 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDCCAG3Q96C92 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDCCAG3Q96C92 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDCCAG3Q96C92 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDCCAG3Q96C92 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDCCAG3Q96C92 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDCCAG3Q96C92 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDCCAG3Q96C92 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDCCAG3Q96C92 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDCCAG3Q96C92 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDCCAG3Q96C92 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDCCAG3Q96C92 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDCCAG3Q96C92 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDCCAG3Q96C92 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDCCAG3Q96C92 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDCCAG3Q96C92 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDCCAG3Q96C92 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDCCAG3Q96C92 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDCCAG3Q96C92 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDCCAG3Q96C92 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDCCAG3Q96C92 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDCCAG3Q96C92 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDCCAG3Q96C92 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDCCAG3Q96C92 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDCCAG3Q96C92 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SDCCAG3Q96C92 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDCCAG3Q96C92 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDCCAG3Q96C92 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDCCAG3Q96C92 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDCCAG3Q96C92 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDCCAG3Q96C92 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDCCAG3Q96C92 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDCCAG3Q96C92 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDCCAG3Q96C92 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDCCAG3Q96C92 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDCCAG3Q96C92 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDCCAG3Q96C92 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDCCAG3Q96C92 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDCCAG3Q96C92 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SDCCAG3Q96C92 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDCCAG3Q96C92 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDCCAG3Q96C92 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDCCAG3Q96C92 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDCCAG3Q96C92 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDCCAG3Q96C92 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDCCAG3Q96C92 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDCCAG3Q96C92 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDCCAG3Q96C92 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDCCAG3Q96C92 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDCCAG3Q96C92 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDCCAG3Q96C92 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDCCAG3Q96C92 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDCCAG3Q96C92 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms