Protein–RNA interactions for Protein: Q96C19

EFHD2, EF-hand domain-containing protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD2Q96C19 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFHD2Q96C19 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFHD2Q96C19 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFHD2Q96C19 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFHD2Q96C19 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFHD2Q96C19 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFHD2Q96C19 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFHD2Q96C19 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFHD2Q96C19 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFHD2Q96C19 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFHD2Q96C19 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EFHD2Q96C19 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EFHD2Q96C19 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EFHD2Q96C19 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EFHD2Q96C19 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EFHD2Q96C19 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EFHD2Q96C19 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EFHD2Q96C19 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EFHD2Q96C19 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EFHD2Q96C19 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EFHD2Q96C19 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EFHD2Q96C19 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
EFHD2Q96C19 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EFHD2Q96C19 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EFHD2Q96C19 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EFHD2Q96C19 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
EFHD2Q96C19 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EFHD2Q96C19 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EFHD2Q96C19 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EFHD2Q96C19 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EFHD2Q96C19 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFHD2Q96C19 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFHD2Q96C19 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFHD2Q96C19 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFHD2Q96C19 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFHD2Q96C19 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFHD2Q96C19 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFHD2Q96C19 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFHD2Q96C19 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFHD2Q96C19 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFHD2Q96C19 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFHD2Q96C19 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFHD2Q96C19 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFHD2Q96C19 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFHD2Q96C19 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFHD2Q96C19 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFHD2Q96C19 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFHD2Q96C19 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFHD2Q96C19 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFHD2Q96C19 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EFHD2Q96C19 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EFHD2Q96C19 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EFHD2Q96C19 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EFHD2Q96C19 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EFHD2Q96C19 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EFHD2Q96C19 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EFHD2Q96C19 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EFHD2Q96C19 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EFHD2Q96C19 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
EFHD2Q96C19 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFHD2Q96C19 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFHD2Q96C19 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFHD2Q96C19 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFHD2Q96C19 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFHD2Q96C19 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFHD2Q96C19 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFHD2Q96C19 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFHD2Q96C19 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFHD2Q96C19 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFHD2Q96C19 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFHD2Q96C19 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFHD2Q96C19 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFHD2Q96C19 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFHD2Q96C19 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFHD2Q96C19 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFHD2Q96C19 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFHD2Q96C19 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFHD2Q96C19 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFHD2Q96C19 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EFHD2Q96C19 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EFHD2Q96C19 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EFHD2Q96C19 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EFHD2Q96C19 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EFHD2Q96C19 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EFHD2Q96C19 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFHD2Q96C19 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFHD2Q96C19 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFHD2Q96C19 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFHD2Q96C19 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EFHD2Q96C19 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFHD2Q96C19 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFHD2Q96C19 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFHD2Q96C19 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFHD2Q96C19 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
EFHD2Q96C19 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EFHD2Q96C19 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EFHD2Q96C19 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
EFHD2Q96C19 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFHD2Q96C19 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFHD2Q96C19 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms