Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMIGD2Q96BF3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMIGD2Q96BF3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMIGD2Q96BF3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMIGD2Q96BF3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TMIGD2Q96BF3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMIGD2Q96BF3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMIGD2Q96BF3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMIGD2Q96BF3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMIGD2Q96BF3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMIGD2Q96BF3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMIGD2Q96BF3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TMIGD2Q96BF3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMIGD2Q96BF3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMIGD2Q96BF3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMIGD2Q96BF3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMIGD2Q96BF3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TMIGD2Q96BF3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMIGD2Q96BF3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMIGD2Q96BF3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
TMIGD2Q96BF3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMIGD2Q96BF3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TMIGD2Q96BF3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMIGD2Q96BF3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMIGD2Q96BF3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMIGD2Q96BF3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMIGD2Q96BF3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMIGD2Q96BF3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMIGD2Q96BF3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMIGD2Q96BF3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMIGD2Q96BF3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMIGD2Q96BF3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMIGD2Q96BF3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMIGD2Q96BF3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMIGD2Q96BF3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMIGD2Q96BF3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMIGD2Q96BF3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMIGD2Q96BF3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMIGD2Q96BF3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMIGD2Q96BF3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMIGD2Q96BF3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMIGD2Q96BF3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TMIGD2Q96BF3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMIGD2Q96BF3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMIGD2Q96BF3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMIGD2Q96BF3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMIGD2Q96BF3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TMIGD2Q96BF3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMIGD2Q96BF3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMIGD2Q96BF3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMIGD2Q96BF3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMIGD2Q96BF3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMIGD2Q96BF3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMIGD2Q96BF3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMIGD2Q96BF3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TMIGD2Q96BF3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMIGD2Q96BF3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMIGD2Q96BF3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMIGD2Q96BF3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TMIGD2Q96BF3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMIGD2Q96BF3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMIGD2Q96BF3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMIGD2Q96BF3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMIGD2Q96BF3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMIGD2Q96BF3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMIGD2Q96BF3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMIGD2Q96BF3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMIGD2Q96BF3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMIGD2Q96BF3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMIGD2Q96BF3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMIGD2Q96BF3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMIGD2Q96BF3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMIGD2Q96BF3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMIGD2Q96BF3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMIGD2Q96BF3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMIGD2Q96BF3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMIGD2Q96BF3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMIGD2Q96BF3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMIGD2Q96BF3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMIGD2Q96BF3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMIGD2Q96BF3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMIGD2Q96BF3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMIGD2Q96BF3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMIGD2Q96BF3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMIGD2Q96BF3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMIGD2Q96BF3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMIGD2Q96BF3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMIGD2Q96BF3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMIGD2Q96BF3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMIGD2Q96BF3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TMIGD2Q96BF3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMIGD2Q96BF3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMIGD2Q96BF3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMIGD2Q96BF3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMIGD2Q96BF3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMIGD2Q96BF3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMIGD2Q96BF3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMIGD2Q96BF3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMIGD2Q96BF3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMIGD2Q96BF3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms