Protein–RNA interactions for Protein: Q969M2

GJA10, Gap junction alpha-10 protein, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA10Q969M2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GJA10Q969M2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GJA10Q969M2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GJA10Q969M2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GJA10Q969M2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
GJA10Q969M2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GJA10Q969M2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GJA10Q969M2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
GJA10Q969M2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GJA10Q969M2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GJA10Q969M2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GJA10Q969M2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GJA10Q969M2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GJA10Q969M2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
GJA10Q969M2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GJA10Q969M2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GJA10Q969M2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GJA10Q969M2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
GJA10Q969M2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GJA10Q969M2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
GJA10Q969M2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GJA10Q969M2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GJA10Q969M2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GJA10Q969M2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GJA10Q969M2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GJA10Q969M2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GJA10Q969M2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GJA10Q969M2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GJA10Q969M2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GJA10Q969M2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GJA10Q969M2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GJA10Q969M2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GJA10Q969M2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GJA10Q969M2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GJA10Q969M2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GJA10Q969M2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GJA10Q969M2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GJA10Q969M2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GJA10Q969M2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
GJA10Q969M2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GJA10Q969M2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GJA10Q969M2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GJA10Q969M2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GJA10Q969M2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GJA10Q969M2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GJA10Q969M2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GJA10Q969M2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
GJA10Q969M2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GJA10Q969M2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GJA10Q969M2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GJA10Q969M2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GJA10Q969M2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GJA10Q969M2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GJA10Q969M2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
GJA10Q969M2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GJA10Q969M2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GJA10Q969M2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
GJA10Q969M2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GJA10Q969M2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
GJA10Q969M2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GJA10Q969M2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GJA10Q969M2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GJA10Q969M2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
GJA10Q969M2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
GJA10Q969M2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GJA10Q969M2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GJA10Q969M2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GJA10Q969M2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GJA10Q969M2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GJA10Q969M2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GJA10Q969M2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GJA10Q969M2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GJA10Q969M2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GJA10Q969M2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GJA10Q969M2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GJA10Q969M2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GJA10Q969M2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GJA10Q969M2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GJA10Q969M2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GJA10Q969M2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GJA10Q969M2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GJA10Q969M2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GJA10Q969M2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GJA10Q969M2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GJA10Q969M2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GJA10Q969M2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GJA10Q969M2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GJA10Q969M2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
GJA10Q969M2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GJA10Q969M2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GJA10Q969M2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
GJA10Q969M2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GJA10Q969M2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GJA10Q969M2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GJA10Q969M2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GJA10Q969M2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GJA10Q969M2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GJA10Q969M2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GJA10Q969M2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GJA10Q969M2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms