Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAMP4Q969E2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAMP4Q969E2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAMP4Q969E2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAMP4Q969E2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAMP4Q969E2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCAMP4Q969E2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCAMP4Q969E2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCAMP4Q969E2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCAMP4Q969E2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCAMP4Q969E2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCAMP4Q969E2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCAMP4Q969E2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SCAMP4Q969E2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAMP4Q969E2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAMP4Q969E2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAMP4Q969E2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAMP4Q969E2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAMP4Q969E2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAMP4Q969E2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAMP4Q969E2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAMP4Q969E2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAMP4Q969E2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCAMP4Q969E2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCAMP4Q969E2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCAMP4Q969E2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAMP4Q969E2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAMP4Q969E2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAMP4Q969E2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAMP4Q969E2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAMP4Q969E2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAMP4Q969E2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAMP4Q969E2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAMP4Q969E2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCAMP4Q969E2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCAMP4Q969E2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCAMP4Q969E2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCAMP4Q969E2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCAMP4Q969E2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCAMP4Q969E2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCAMP4Q969E2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SCAMP4Q969E2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCAMP4Q969E2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCAMP4Q969E2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCAMP4Q969E2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCAMP4Q969E2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SCAMP4Q969E2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCAMP4Q969E2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SCAMP4Q969E2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCAMP4Q969E2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCAMP4Q969E2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCAMP4Q969E2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAMP4Q969E2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAMP4Q969E2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAMP4Q969E2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAMP4Q969E2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAMP4Q969E2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCAMP4Q969E2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCAMP4Q969E2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCAMP4Q969E2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCAMP4Q969E2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SCAMP4Q969E2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SCAMP4Q969E2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCAMP4Q969E2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCAMP4Q969E2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCAMP4Q969E2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAMP4Q969E2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAMP4Q969E2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAMP4Q969E2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAMP4Q969E2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAMP4Q969E2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAMP4Q969E2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCAMP4Q969E2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCAMP4Q969E2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SCAMP4Q969E2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCAMP4Q969E2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCAMP4Q969E2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCAMP4Q969E2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCAMP4Q969E2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCAMP4Q969E2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCAMP4Q969E2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCAMP4Q969E2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCAMP4Q969E2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCAMP4Q969E2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SCAMP4Q969E2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCAMP4Q969E2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCAMP4Q969E2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCAMP4Q969E2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCAMP4Q969E2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCAMP4Q969E2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCAMP4Q969E2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCAMP4Q969E2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCAMP4Q969E2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCAMP4Q969E2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCAMP4Q969E2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SCAMP4Q969E2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCAMP4Q969E2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCAMP4Q969E2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCAMP4Q969E2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCAMP4Q969E2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms