Protein–RNA interactions for Protein: Q969D9

TSLP, Thymic stromal lymphopoietin, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSLPQ969D9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSLPQ969D9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSLPQ969D9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSLPQ969D9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSLPQ969D9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSLPQ969D9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSLPQ969D9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSLPQ969D9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSLPQ969D9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSLPQ969D9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSLPQ969D9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSLPQ969D9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSLPQ969D9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSLPQ969D9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSLPQ969D9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSLPQ969D9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSLPQ969D9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSLPQ969D9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TSLPQ969D9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSLPQ969D9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSLPQ969D9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TSLPQ969D9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSLPQ969D9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TSLPQ969D9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TSLPQ969D9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSLPQ969D9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSLPQ969D9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TSLPQ969D9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSLPQ969D9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TSLPQ969D9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TSLPQ969D9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSLPQ969D9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSLPQ969D9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSLPQ969D9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSLPQ969D9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSLPQ969D9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSLPQ969D9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSLPQ969D9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSLPQ969D9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TSLPQ969D9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSLPQ969D9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSLPQ969D9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSLPQ969D9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSLPQ969D9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSLPQ969D9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSLPQ969D9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSLPQ969D9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSLPQ969D9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSLPQ969D9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSLPQ969D9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSLPQ969D9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSLPQ969D9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TSLPQ969D9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TSLPQ969D9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSLPQ969D9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TSLPQ969D9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSLPQ969D9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSLPQ969D9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSLPQ969D9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSLPQ969D9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSLPQ969D9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSLPQ969D9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSLPQ969D9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSLPQ969D9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSLPQ969D9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSLPQ969D9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSLPQ969D9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSLPQ969D9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TSLPQ969D9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSLPQ969D9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSLPQ969D9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSLPQ969D9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSLPQ969D9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSLPQ969D9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSLPQ969D9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSLPQ969D9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSLPQ969D9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSLPQ969D9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSLPQ969D9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSLPQ969D9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSLPQ969D9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSLPQ969D9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TSLPQ969D9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TSLPQ969D9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSLPQ969D9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSLPQ969D9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSLPQ969D9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSLPQ969D9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSLPQ969D9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSLPQ969D9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSLPQ969D9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSLPQ969D9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSLPQ969D9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSLPQ969D9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSLPQ969D9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSLPQ969D9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSLPQ969D9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSLPQ969D9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSLPQ969D9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSLPQ969D9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.5 ms