Protein–RNA interactions for Protein: Q93099

HGD, Homogentisate 1,2-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HGDQ93099 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HGDQ93099 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HGDQ93099 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HGDQ93099 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HGDQ93099 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HGDQ93099 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HGDQ93099 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HGDQ93099 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HGDQ93099 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HGDQ93099 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HGDQ93099 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HGDQ93099 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HGDQ93099 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HGDQ93099 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HGDQ93099 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HGDQ93099 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HGDQ93099 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HGDQ93099 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HGDQ93099 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HGDQ93099 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HGDQ93099 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HGDQ93099 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HGDQ93099 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HGDQ93099 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HGDQ93099 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HGDQ93099 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HGDQ93099 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HGDQ93099 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HGDQ93099 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HGDQ93099 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HGDQ93099 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HGDQ93099 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HGDQ93099 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HGDQ93099 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HGDQ93099 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HGDQ93099 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HGDQ93099 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HGDQ93099 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HGDQ93099 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HGDQ93099 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
HGDQ93099 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HGDQ93099 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HGDQ93099 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HGDQ93099 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HGDQ93099 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HGDQ93099 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HGDQ93099 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HGDQ93099 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HGDQ93099 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HGDQ93099 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HGDQ93099 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HGDQ93099 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HGDQ93099 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HGDQ93099 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HGDQ93099 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HGDQ93099 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HGDQ93099 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HGDQ93099 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HGDQ93099 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HGDQ93099 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HGDQ93099 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HGDQ93099 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HGDQ93099 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HGDQ93099 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HGDQ93099 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HGDQ93099 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HGDQ93099 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HGDQ93099 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HGDQ93099 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HGDQ93099 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HGDQ93099 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HGDQ93099 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HGDQ93099 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HGDQ93099 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HGDQ93099 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HGDQ93099 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HGDQ93099 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HGDQ93099 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HGDQ93099 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HGDQ93099 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HGDQ93099 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HGDQ93099 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HGDQ93099 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HGDQ93099 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HGDQ93099 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HGDQ93099 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HGDQ93099 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HGDQ93099 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HGDQ93099 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HGDQ93099 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HGDQ93099 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HGDQ93099 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HGDQ93099 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HGDQ93099 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HGDQ93099 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HGDQ93099 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HGDQ93099 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HGDQ93099 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HGDQ93099 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HGDQ93099 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms