Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2A3Q93084 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2A3Q93084 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2A3Q93084 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2A3Q93084 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2A3Q93084 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2A3Q93084 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2A3Q93084 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2A3Q93084 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2A3Q93084 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2A3Q93084 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2A3Q93084 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATP2A3Q93084 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATP2A3Q93084 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP2A3Q93084 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP2A3Q93084 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2A3Q93084 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2A3Q93084 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2A3Q93084 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2A3Q93084 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2A3Q93084 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2A3Q93084 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2A3Q93084 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2A3Q93084 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2A3Q93084 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP2A3Q93084 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP2A3Q93084 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP2A3Q93084 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP2A3Q93084 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP2A3Q93084 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP2A3Q93084 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP2A3Q93084 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP2A3Q93084 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP2A3Q93084 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP2A3Q93084 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP2A3Q93084 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP2A3Q93084 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP2A3Q93084 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP2A3Q93084 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP2A3Q93084 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP2A3Q93084 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP2A3Q93084 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP2A3Q93084 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP2A3Q93084 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP2A3Q93084 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP2A3Q93084 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP2A3Q93084 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP2A3Q93084 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP2A3Q93084 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP2A3Q93084 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP2A3Q93084 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP2A3Q93084 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP2A3Q93084 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP2A3Q93084 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP2A3Q93084 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP2A3Q93084 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP2A3Q93084 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATP2A3Q93084 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP2A3Q93084 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP2A3Q93084 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP2A3Q93084 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP2A3Q93084 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP2A3Q93084 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP2A3Q93084 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP2A3Q93084 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP2A3Q93084 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP2A3Q93084 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP2A3Q93084 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP2A3Q93084 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP2A3Q93084 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP2A3Q93084 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP2A3Q93084 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP2A3Q93084 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP2A3Q93084 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP2A3Q93084 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP2A3Q93084 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP2A3Q93084 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP2A3Q93084 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP2A3Q93084 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP2A3Q93084 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP2A3Q93084 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP2A3Q93084 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP2A3Q93084 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP2A3Q93084 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP2A3Q93084 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP2A3Q93084 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ATP2A3Q93084 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ATP2A3Q93084 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP2A3Q93084 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP2A3Q93084 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP2A3Q93084 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP2A3Q93084 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP2A3Q93084 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP2A3Q93084 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP2A3Q93084 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP2A3Q93084 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP2A3Q93084 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP2A3Q93084 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP2A3Q93084 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP2A3Q93084 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms