Protein–RNA interactions for Protein: Q93074

MED12, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 2,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED12Q93074 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED12Q93074 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED12Q93074 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED12Q93074 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED12Q93074 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED12Q93074 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED12Q93074 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED12Q93074 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED12Q93074 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED12Q93074 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED12Q93074 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MED12Q93074 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED12Q93074 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MED12Q93074 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MED12Q93074 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED12Q93074 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED12Q93074 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED12Q93074 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED12Q93074 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED12Q93074 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED12Q93074 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED12Q93074 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED12Q93074 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MED12Q93074 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED12Q93074 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED12Q93074 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED12Q93074 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED12Q93074 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED12Q93074 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MED12Q93074 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED12Q93074 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED12Q93074 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED12Q93074 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MED12Q93074 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED12Q93074 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED12Q93074 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED12Q93074 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED12Q93074 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED12Q93074 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED12Q93074 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED12Q93074 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MED12Q93074 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED12Q93074 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED12Q93074 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED12Q93074 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MED12Q93074 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED12Q93074 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED12Q93074 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MED12Q93074 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED12Q93074 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED12Q93074 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED12Q93074 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED12Q93074 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED12Q93074 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED12Q93074 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MED12Q93074 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED12Q93074 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED12Q93074 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED12Q93074 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED12Q93074 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED12Q93074 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED12Q93074 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED12Q93074 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED12Q93074 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED12Q93074 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED12Q93074 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED12Q93074 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MED12Q93074 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED12Q93074 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED12Q93074 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED12Q93074 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED12Q93074 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MED12Q93074 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED12Q93074 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED12Q93074 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MED12Q93074 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED12Q93074 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED12Q93074 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED12Q93074 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MED12Q93074 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED12Q93074 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED12Q93074 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED12Q93074 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED12Q93074 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED12Q93074 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED12Q93074 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MED12Q93074 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED12Q93074 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED12Q93074 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED12Q93074 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED12Q93074 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MED12Q93074 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED12Q93074 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED12Q93074 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED12Q93074 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED12Q93074 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED12Q93074 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MED12Q93074 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED12Q93074 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED12Q93074 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms