Protein–RNA interactions for Protein: Q93038

TNFRSF25, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 25, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25Q93038 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNFRSF25Q93038 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNFRSF25Q93038 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNFRSF25Q93038 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNFRSF25Q93038 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNFRSF25Q93038 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNFRSF25Q93038 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNFRSF25Q93038 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNFRSF25Q93038 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNFRSF25Q93038 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNFRSF25Q93038 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNFRSF25Q93038 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNFRSF25Q93038 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNFRSF25Q93038 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNFRSF25Q93038 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNFRSF25Q93038 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TNFRSF25Q93038 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNFRSF25Q93038 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNFRSF25Q93038 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TNFRSF25Q93038 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNFRSF25Q93038 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNFRSF25Q93038 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TNFRSF25Q93038 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TNFRSF25Q93038 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TNFRSF25Q93038 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TNFRSF25Q93038 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNFRSF25Q93038 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNFRSF25Q93038 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNFRSF25Q93038 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNFRSF25Q93038 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNFRSF25Q93038 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNFRSF25Q93038 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNFRSF25Q93038 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TNFRSF25Q93038 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNFRSF25Q93038 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNFRSF25Q93038 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNFRSF25Q93038 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNFRSF25Q93038 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNFRSF25Q93038 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNFRSF25Q93038 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNFRSF25Q93038 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNFRSF25Q93038 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNFRSF25Q93038 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNFRSF25Q93038 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNFRSF25Q93038 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNFRSF25Q93038 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNFRSF25Q93038 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNFRSF25Q93038 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNFRSF25Q93038 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNFRSF25Q93038 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNFRSF25Q93038 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNFRSF25Q93038 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNFRSF25Q93038 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNFRSF25Q93038 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNFRSF25Q93038 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNFRSF25Q93038 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNFRSF25Q93038 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNFRSF25Q93038 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNFRSF25Q93038 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNFRSF25Q93038 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNFRSF25Q93038 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNFRSF25Q93038 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TNFRSF25Q93038 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNFRSF25Q93038 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNFRSF25Q93038 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNFRSF25Q93038 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNFRSF25Q93038 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNFRSF25Q93038 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TNFRSF25Q93038 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNFRSF25Q93038 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNFRSF25Q93038 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNFRSF25Q93038 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNFRSF25Q93038 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNFRSF25Q93038 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNFRSF25Q93038 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNFRSF25Q93038 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNFRSF25Q93038 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TNFRSF25Q93038 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNFRSF25Q93038 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TNFRSF25Q93038 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TNFRSF25Q93038 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TNFRSF25Q93038 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TNFRSF25Q93038 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNFRSF25Q93038 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNFRSF25Q93038 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNFRSF25Q93038 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNFRSF25Q93038 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNFRSF25Q93038 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNFRSF25Q93038 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TNFRSF25Q93038 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNFRSF25Q93038 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNFRSF25Q93038 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNFRSF25Q93038 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNFRSF25Q93038 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNFRSF25Q93038 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TNFRSF25Q93038 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TNFRSF25Q93038 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TNFRSF25Q93038 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TNFRSF25Q93038 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNFRSF25Q93038 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms