Protein–RNA interactions for Protein: Q92989

CLP1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLP1Q92989 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLP1Q92989 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLP1Q92989 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLP1Q92989 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLP1Q92989 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLP1Q92989 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLP1Q92989 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLP1Q92989 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLP1Q92989 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLP1Q92989 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLP1Q92989 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CLP1Q92989 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CLP1Q92989 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLP1Q92989 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLP1Q92989 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLP1Q92989 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLP1Q92989 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLP1Q92989 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CLP1Q92989 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLP1Q92989 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLP1Q92989 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLP1Q92989 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLP1Q92989 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLP1Q92989 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLP1Q92989 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLP1Q92989 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CLP1Q92989 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLP1Q92989 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLP1Q92989 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLP1Q92989 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLP1Q92989 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLP1Q92989 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLP1Q92989 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CLP1Q92989 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLP1Q92989 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLP1Q92989 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLP1Q92989 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CLP1Q92989 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLP1Q92989 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLP1Q92989 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CLP1Q92989 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CLP1Q92989 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CLP1Q92989 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CLP1Q92989 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLP1Q92989 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLP1Q92989 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLP1Q92989 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLP1Q92989 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLP1Q92989 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLP1Q92989 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLP1Q92989 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLP1Q92989 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLP1Q92989 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLP1Q92989 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLP1Q92989 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLP1Q92989 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLP1Q92989 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLP1Q92989 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLP1Q92989 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLP1Q92989 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLP1Q92989 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLP1Q92989 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLP1Q92989 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLP1Q92989 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLP1Q92989 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLP1Q92989 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLP1Q92989 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLP1Q92989 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLP1Q92989 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLP1Q92989 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLP1Q92989 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLP1Q92989 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLP1Q92989 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLP1Q92989 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLP1Q92989 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLP1Q92989 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CLP1Q92989 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLP1Q92989 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CLP1Q92989 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CLP1Q92989 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CLP1Q92989 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLP1Q92989 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CLP1Q92989 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLP1Q92989 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CLP1Q92989 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLP1Q92989 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLP1Q92989 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLP1Q92989 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLP1Q92989 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLP1Q92989 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLP1Q92989 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLP1Q92989 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLP1Q92989 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLP1Q92989 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLP1Q92989 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLP1Q92989 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLP1Q92989 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLP1Q92989 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLP1Q92989 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLP1Q92989 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms