Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GTF3AQ92664 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF3AQ92664 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF3AQ92664 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF3AQ92664 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF3AQ92664 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF3AQ92664 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF3AQ92664 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF3AQ92664 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF3AQ92664 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GTF3AQ92664 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF3AQ92664 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF3AQ92664 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF3AQ92664 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF3AQ92664 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF3AQ92664 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF3AQ92664 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF3AQ92664 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF3AQ92664 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF3AQ92664 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF3AQ92664 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF3AQ92664 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF3AQ92664 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF3AQ92664 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF3AQ92664 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF3AQ92664 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF3AQ92664 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF3AQ92664 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF3AQ92664 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF3AQ92664 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF3AQ92664 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF3AQ92664 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF3AQ92664 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF3AQ92664 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF3AQ92664 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF3AQ92664 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF3AQ92664 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF3AQ92664 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF3AQ92664 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF3AQ92664 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF3AQ92664 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF3AQ92664 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF3AQ92664 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF3AQ92664 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF3AQ92664 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF3AQ92664 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF3AQ92664 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF3AQ92664 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF3AQ92664 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF3AQ92664 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF3AQ92664 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GTF3AQ92664 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF3AQ92664 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF3AQ92664 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF3AQ92664 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF3AQ92664 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF3AQ92664 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF3AQ92664 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF3AQ92664 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF3AQ92664 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF3AQ92664 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF3AQ92664 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF3AQ92664 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF3AQ92664 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF3AQ92664 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF3AQ92664 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF3AQ92664 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF3AQ92664 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF3AQ92664 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF3AQ92664 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF3AQ92664 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF3AQ92664 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF3AQ92664 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF3AQ92664 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF3AQ92664 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GTF3AQ92664 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF3AQ92664 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF3AQ92664 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF3AQ92664 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF3AQ92664 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GTF3AQ92664 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GTF3AQ92664 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GTF3AQ92664 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GTF3AQ92664 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF3AQ92664 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF3AQ92664 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF3AQ92664 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF3AQ92664 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF3AQ92664 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF3AQ92664 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF3AQ92664 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF3AQ92664 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF3AQ92664 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF3AQ92664 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF3AQ92664 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF3AQ92664 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF3AQ92664 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF3AQ92664 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF3AQ92664 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GTF3AQ92664 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms