Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
TOPBP1Q92547 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC42.32■■■■■ 4.37
TOPBP1Q92547 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC42.31■■■■■ 4.36
TOPBP1Q92547 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
TOPBP1Q92547 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
TOPBP1Q92547 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.3■■■■■ 4.36
TOPBP1Q92547 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC42.3■■■■■ 4.36
TOPBP1Q92547 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
TOPBP1Q92547 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC42.29■■■■■ 4.36
TOPBP1Q92547 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC42.29■■■■■ 4.36
TOPBP1Q92547 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
TOPBP1Q92547 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
TOPBP1Q92547 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC42.27■■■■■ 4.36
TOPBP1Q92547 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC42.27■■■■■ 4.36
TOPBP1Q92547 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
TOPBP1Q92547 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
TOPBP1Q92547 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
TOPBP1Q92547 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
TOPBP1Q92547 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.25■■■■■ 4.35
TOPBP1Q92547 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC42.24■■■■■ 4.35
TOPBP1Q92547 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.24■■■■■ 4.35
TOPBP1Q92547 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
TOPBP1Q92547 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC42.23■■■■■ 4.35
TOPBP1Q92547 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC42.23■■■■■ 4.35
TOPBP1Q92547 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC42.23■■■■■ 4.35
TOPBP1Q92547 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
TOPBP1Q92547 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
TOPBP1Q92547 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
TOPBP1Q92547 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
TOPBP1Q92547 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC42.21■■■■■ 4.35
TOPBP1Q92547 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC42.21■■■■■ 4.35
TOPBP1Q92547 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.21■■■■■ 4.35
TOPBP1Q92547 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
TOPBP1Q92547 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
TOPBP1Q92547 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
TOPBP1Q92547 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.19■■■■■ 4.34
TOPBP1Q92547 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
TOPBP1Q92547 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC42.19■■■■■ 4.34
TOPBP1Q92547 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.18■■■■■ 4.34
TOPBP1Q92547 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.18■■■■■ 4.34
TOPBP1Q92547 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
TOPBP1Q92547 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
TOPBP1Q92547 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
TOPBP1Q92547 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
TOPBP1Q92547 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
TOPBP1Q92547 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC42.16■■■■■ 4.34
TOPBP1Q92547 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC42.16■■■■■ 4.34
TOPBP1Q92547 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC42.16■■■■■ 4.34
TOPBP1Q92547 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC42.16■■■■■ 4.34
TOPBP1Q92547 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
TOPBP1Q92547 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC42.15■■■■■ 4.34
TOPBP1Q92547 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC42.15■■■■■ 4.34
TOPBP1Q92547 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.15■■■■■ 4.34
TOPBP1Q92547 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
TOPBP1Q92547 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
TOPBP1Q92547 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.34
TOPBP1Q92547 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC42.12■■■■■ 4.33
TOPBP1Q92547 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC42.12■■■■■ 4.33
TOPBP1Q92547 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
TOPBP1Q92547 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC42.11■■■■■ 4.33
TOPBP1Q92547 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.11■■■■■ 4.33
TOPBP1Q92547 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC42.11■■■■■ 4.33
TOPBP1Q92547 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC42.1■■■■■ 4.33
TOPBP1Q92547 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
TOPBP1Q92547 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC42.1■■■■■ 4.33
TOPBP1Q92547 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
TOPBP1Q92547 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
TOPBP1Q92547 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
TOPBP1Q92547 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
TOPBP1Q92547 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
TOPBP1Q92547 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
TOPBP1Q92547 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
TOPBP1Q92547 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC42.05■■■■■ 4.32
TOPBP1Q92547 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC42.05■■■■■ 4.32
TOPBP1Q92547 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
TOPBP1Q92547 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
TOPBP1Q92547 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC42.05■■■■■ 4.32
TOPBP1Q92547 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC42.04■■■■■ 4.32
TOPBP1Q92547 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC42.04■■■■■ 4.32
TOPBP1Q92547 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
TOPBP1Q92547 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
TOPBP1Q92547 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC42.03■■■■■ 4.32
TOPBP1Q92547 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC42.03■■■■■ 4.32
TOPBP1Q92547 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
TOPBP1Q92547 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
TOPBP1Q92547 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
TOPBP1Q92547 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC42.01■■■■■ 4.32
TOPBP1Q92547 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
TOPBP1Q92547 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
TOPBP1Q92547 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42■■■■■ 4.31
TOPBP1Q92547 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC42■■■■■ 4.31
TOPBP1Q92547 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
TOPBP1Q92547 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC41.98■■■■■ 4.31
TOPBP1Q92547 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC41.98■■■■■ 4.31
TOPBP1Q92547 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
TOPBP1Q92547 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC41.97■■■■■ 4.31
TOPBP1Q92547 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC41.97■■■■■ 4.31
TOPBP1Q92547 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC41.97■■■■■ 4.31
TOPBP1Q92547 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC41.96■■■■■ 4.31
TOPBP1Q92547 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC41.96■■■■■ 4.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms