Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ69

C11orf40, Putative uncharacterized protein C11orf40, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf40Q8WZ69 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
C11orf40Q8WZ69 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C11orf40Q8WZ69 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C11orf40Q8WZ69 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
C11orf40Q8WZ69 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C11orf40Q8WZ69 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C11orf40Q8WZ69 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C11orf40Q8WZ69 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C11orf40Q8WZ69 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C11orf40Q8WZ69 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C11orf40Q8WZ69 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C11orf40Q8WZ69 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C11orf40Q8WZ69 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C11orf40Q8WZ69 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C11orf40Q8WZ69 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C11orf40Q8WZ69 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C11orf40Q8WZ69 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C11orf40Q8WZ69 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C11orf40Q8WZ69 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C11orf40Q8WZ69 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C11orf40Q8WZ69 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C11orf40Q8WZ69 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
C11orf40Q8WZ69 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C11orf40Q8WZ69 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C11orf40Q8WZ69 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
C11orf40Q8WZ69 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
C11orf40Q8WZ69 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C11orf40Q8WZ69 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C11orf40Q8WZ69 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C11orf40Q8WZ69 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C11orf40Q8WZ69 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C11orf40Q8WZ69 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C11orf40Q8WZ69 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C11orf40Q8WZ69 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C11orf40Q8WZ69 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C11orf40Q8WZ69 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C11orf40Q8WZ69 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C11orf40Q8WZ69 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C11orf40Q8WZ69 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C11orf40Q8WZ69 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C11orf40Q8WZ69 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C11orf40Q8WZ69 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C11orf40Q8WZ69 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C11orf40Q8WZ69 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C11orf40Q8WZ69 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C11orf40Q8WZ69 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C11orf40Q8WZ69 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C11orf40Q8WZ69 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C11orf40Q8WZ69 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C11orf40Q8WZ69 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C11orf40Q8WZ69 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C11orf40Q8WZ69 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C11orf40Q8WZ69 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C11orf40Q8WZ69 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C11orf40Q8WZ69 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C11orf40Q8WZ69 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C11orf40Q8WZ69 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C11orf40Q8WZ69 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C11orf40Q8WZ69 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C11orf40Q8WZ69 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C11orf40Q8WZ69 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C11orf40Q8WZ69 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C11orf40Q8WZ69 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C11orf40Q8WZ69 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C11orf40Q8WZ69 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C11orf40Q8WZ69 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C11orf40Q8WZ69 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C11orf40Q8WZ69 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C11orf40Q8WZ69 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C11orf40Q8WZ69 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C11orf40Q8WZ69 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C11orf40Q8WZ69 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C11orf40Q8WZ69 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C11orf40Q8WZ69 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
C11orf40Q8WZ69 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C11orf40Q8WZ69 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C11orf40Q8WZ69 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C11orf40Q8WZ69 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C11orf40Q8WZ69 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C11orf40Q8WZ69 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C11orf40Q8WZ69 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C11orf40Q8WZ69 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C11orf40Q8WZ69 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C11orf40Q8WZ69 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C11orf40Q8WZ69 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C11orf40Q8WZ69 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C11orf40Q8WZ69 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C11orf40Q8WZ69 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C11orf40Q8WZ69 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C11orf40Q8WZ69 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C11orf40Q8WZ69 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C11orf40Q8WZ69 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C11orf40Q8WZ69 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C11orf40Q8WZ69 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C11orf40Q8WZ69 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C11orf40Q8WZ69 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C11orf40Q8WZ69 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C11orf40Q8WZ69 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C11orf40Q8WZ69 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C11orf40Q8WZ69 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
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