Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF7

ATL1, Atlastin-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL1Q8WXF7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATL1Q8WXF7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATL1Q8WXF7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATL1Q8WXF7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATL1Q8WXF7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATL1Q8WXF7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATL1Q8WXF7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATL1Q8WXF7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATL1Q8WXF7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATL1Q8WXF7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATL1Q8WXF7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATL1Q8WXF7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATL1Q8WXF7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATL1Q8WXF7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATL1Q8WXF7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATL1Q8WXF7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATL1Q8WXF7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATL1Q8WXF7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATL1Q8WXF7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATL1Q8WXF7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATL1Q8WXF7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATL1Q8WXF7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATL1Q8WXF7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATL1Q8WXF7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATL1Q8WXF7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATL1Q8WXF7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATL1Q8WXF7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATL1Q8WXF7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATL1Q8WXF7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATL1Q8WXF7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATL1Q8WXF7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATL1Q8WXF7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATL1Q8WXF7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATL1Q8WXF7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATL1Q8WXF7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATL1Q8WXF7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATL1Q8WXF7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATL1Q8WXF7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATL1Q8WXF7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATL1Q8WXF7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATL1Q8WXF7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATL1Q8WXF7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATL1Q8WXF7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATL1Q8WXF7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATL1Q8WXF7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATL1Q8WXF7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATL1Q8WXF7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATL1Q8WXF7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ATL1Q8WXF7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATL1Q8WXF7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ATL1Q8WXF7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ATL1Q8WXF7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATL1Q8WXF7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATL1Q8WXF7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATL1Q8WXF7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ATL1Q8WXF7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATL1Q8WXF7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATL1Q8WXF7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATL1Q8WXF7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATL1Q8WXF7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATL1Q8WXF7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATL1Q8WXF7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATL1Q8WXF7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATL1Q8WXF7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATL1Q8WXF7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATL1Q8WXF7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ATL1Q8WXF7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATL1Q8WXF7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATL1Q8WXF7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATL1Q8WXF7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATL1Q8WXF7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATL1Q8WXF7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATL1Q8WXF7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATL1Q8WXF7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATL1Q8WXF7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATL1Q8WXF7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATL1Q8WXF7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATL1Q8WXF7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATL1Q8WXF7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATL1Q8WXF7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATL1Q8WXF7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATL1Q8WXF7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATL1Q8WXF7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATL1Q8WXF7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATL1Q8WXF7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATL1Q8WXF7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATL1Q8WXF7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATL1Q8WXF7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATL1Q8WXF7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATL1Q8WXF7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATL1Q8WXF7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATL1Q8WXF7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATL1Q8WXF7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATL1Q8WXF7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATL1Q8WXF7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATL1Q8WXF7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATL1Q8WXF7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATL1Q8WXF7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATL1Q8WXF7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATL1Q8WXF7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms