Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE99

PXYLP1, 2-phosphoxylose phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXYLP1Q8TE99 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PXYLP1Q8TE99 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PXYLP1Q8TE99 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PXYLP1Q8TE99 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PXYLP1Q8TE99 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PXYLP1Q8TE99 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PXYLP1Q8TE99 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PXYLP1Q8TE99 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PXYLP1Q8TE99 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PXYLP1Q8TE99 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PXYLP1Q8TE99 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PXYLP1Q8TE99 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PXYLP1Q8TE99 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PXYLP1Q8TE99 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PXYLP1Q8TE99 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PXYLP1Q8TE99 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PXYLP1Q8TE99 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PXYLP1Q8TE99 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PXYLP1Q8TE99 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PXYLP1Q8TE99 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PXYLP1Q8TE99 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PXYLP1Q8TE99 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PXYLP1Q8TE99 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PXYLP1Q8TE99 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PXYLP1Q8TE99 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PXYLP1Q8TE99 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PXYLP1Q8TE99 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PXYLP1Q8TE99 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PXYLP1Q8TE99 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PXYLP1Q8TE99 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PXYLP1Q8TE99 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PXYLP1Q8TE99 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PXYLP1Q8TE99 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PXYLP1Q8TE99 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PXYLP1Q8TE99 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PXYLP1Q8TE99 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PXYLP1Q8TE99 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PXYLP1Q8TE99 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PXYLP1Q8TE99 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PXYLP1Q8TE99 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PXYLP1Q8TE99 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PXYLP1Q8TE99 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PXYLP1Q8TE99 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PXYLP1Q8TE99 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PXYLP1Q8TE99 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PXYLP1Q8TE99 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PXYLP1Q8TE99 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PXYLP1Q8TE99 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PXYLP1Q8TE99 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PXYLP1Q8TE99 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
PXYLP1Q8TE99 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PXYLP1Q8TE99 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PXYLP1Q8TE99 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PXYLP1Q8TE99 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PXYLP1Q8TE99 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PXYLP1Q8TE99 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PXYLP1Q8TE99 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PXYLP1Q8TE99 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PXYLP1Q8TE99 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PXYLP1Q8TE99 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PXYLP1Q8TE99 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PXYLP1Q8TE99 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PXYLP1Q8TE99 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PXYLP1Q8TE99 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PXYLP1Q8TE99 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PXYLP1Q8TE99 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PXYLP1Q8TE99 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PXYLP1Q8TE99 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PXYLP1Q8TE99 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PXYLP1Q8TE99 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PXYLP1Q8TE99 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PXYLP1Q8TE99 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PXYLP1Q8TE99 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PXYLP1Q8TE99 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PXYLP1Q8TE99 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PXYLP1Q8TE99 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PXYLP1Q8TE99 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PXYLP1Q8TE99 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PXYLP1Q8TE99 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PXYLP1Q8TE99 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PXYLP1Q8TE99 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PXYLP1Q8TE99 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PXYLP1Q8TE99 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PXYLP1Q8TE99 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PXYLP1Q8TE99 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PXYLP1Q8TE99 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PXYLP1Q8TE99 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PXYLP1Q8TE99 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PXYLP1Q8TE99 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PXYLP1Q8TE99 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PXYLP1Q8TE99 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PXYLP1Q8TE99 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PXYLP1Q8TE99 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PXYLP1Q8TE99 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PXYLP1Q8TE99 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PXYLP1Q8TE99 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PXYLP1Q8TE99 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PXYLP1Q8TE99 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PXYLP1Q8TE99 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PXYLP1Q8TE99 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms