Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBC4

UBA3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, humanhuman

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA3Q8TBC4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBA3Q8TBC4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBA3Q8TBC4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBA3Q8TBC4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
UBA3Q8TBC4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBA3Q8TBC4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBA3Q8TBC4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBA3Q8TBC4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBA3Q8TBC4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBA3Q8TBC4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBA3Q8TBC4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
UBA3Q8TBC4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBA3Q8TBC4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBA3Q8TBC4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBA3Q8TBC4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBA3Q8TBC4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBA3Q8TBC4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBA3Q8TBC4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBA3Q8TBC4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBA3Q8TBC4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBA3Q8TBC4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBA3Q8TBC4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBA3Q8TBC4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBA3Q8TBC4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBA3Q8TBC4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBA3Q8TBC4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBA3Q8TBC4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBA3Q8TBC4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBA3Q8TBC4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBA3Q8TBC4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBA3Q8TBC4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBA3Q8TBC4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBA3Q8TBC4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBA3Q8TBC4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26■■□□□ 1.75
UBA3Q8TBC4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBA3Q8TBC4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBA3Q8TBC4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBA3Q8TBC4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
UBA3Q8TBC4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBA3Q8TBC4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBA3Q8TBC4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBA3Q8TBC4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBA3Q8TBC4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBA3Q8TBC4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBA3Q8TBC4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBA3Q8TBC4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBA3Q8TBC4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBA3Q8TBC4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBA3Q8TBC4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBA3Q8TBC4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBA3Q8TBC4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBA3Q8TBC4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBA3Q8TBC4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBA3Q8TBC4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
UBA3Q8TBC4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBA3Q8TBC4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBA3Q8TBC4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBA3Q8TBC4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBA3Q8TBC4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBA3Q8TBC4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBA3Q8TBC4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBA3Q8TBC4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBA3Q8TBC4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
UBA3Q8TBC4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
UBA3Q8TBC4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
UBA3Q8TBC4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
UBA3Q8TBC4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
UBA3Q8TBC4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBA3Q8TBC4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
UBA3Q8TBC4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBA3Q8TBC4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBA3Q8TBC4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBA3Q8TBC4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBA3Q8TBC4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBA3Q8TBC4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBA3Q8TBC4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBA3Q8TBC4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBA3Q8TBC4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBA3Q8TBC4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBA3Q8TBC4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBA3Q8TBC4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBA3Q8TBC4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBA3Q8TBC4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBA3Q8TBC4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBA3Q8TBC4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
UBA3Q8TBC4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBA3Q8TBC4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBA3Q8TBC4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBA3Q8TBC4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBA3Q8TBC4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBA3Q8TBC4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBA3Q8TBC4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBA3Q8TBC4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBA3Q8TBC4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBA3Q8TBC4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
UBA3Q8TBC4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBA3Q8TBC4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBA3Q8TBC4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBA3Q8TBC4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBA3Q8TBC4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
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