Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA6DQ8NFY4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA6DQ8NFY4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA6DQ8NFY4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA6DQ8NFY4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA6DQ8NFY4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA6DQ8NFY4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA6DQ8NFY4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA6DQ8NFY4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA6DQ8NFY4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA6DQ8NFY4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA6DQ8NFY4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA6DQ8NFY4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA6DQ8NFY4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA6DQ8NFY4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA6DQ8NFY4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA6DQ8NFY4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA6DQ8NFY4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA6DQ8NFY4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA6DQ8NFY4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA6DQ8NFY4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA6DQ8NFY4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA6DQ8NFY4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA6DQ8NFY4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA6DQ8NFY4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA6DQ8NFY4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA6DQ8NFY4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA6DQ8NFY4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA6DQ8NFY4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA6DQ8NFY4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA6DQ8NFY4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA6DQ8NFY4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA6DQ8NFY4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA6DQ8NFY4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA6DQ8NFY4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA6DQ8NFY4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA6DQ8NFY4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA6DQ8NFY4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA6DQ8NFY4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA6DQ8NFY4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA6DQ8NFY4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA6DQ8NFY4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA6DQ8NFY4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA6DQ8NFY4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA6DQ8NFY4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA6DQ8NFY4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA6DQ8NFY4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA6DQ8NFY4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA6DQ8NFY4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA6DQ8NFY4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA6DQ8NFY4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA6DQ8NFY4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA6DQ8NFY4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA6DQ8NFY4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA6DQ8NFY4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA6DQ8NFY4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA6DQ8NFY4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA6DQ8NFY4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA6DQ8NFY4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA6DQ8NFY4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA6DQ8NFY4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA6DQ8NFY4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA6DQ8NFY4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA6DQ8NFY4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA6DQ8NFY4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA6DQ8NFY4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA6DQ8NFY4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA6DQ8NFY4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA6DQ8NFY4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA6DQ8NFY4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA6DQ8NFY4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA6DQ8NFY4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA6DQ8NFY4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA6DQ8NFY4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA6DQ8NFY4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA6DQ8NFY4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA6DQ8NFY4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA6DQ8NFY4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA6DQ8NFY4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA6DQ8NFY4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA6DQ8NFY4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA6DQ8NFY4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA6DQ8NFY4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA6DQ8NFY4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA6DQ8NFY4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA6DQ8NFY4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA6DQ8NFY4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA6DQ8NFY4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA6DQ8NFY4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA6DQ8NFY4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA6DQ8NFY4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA6DQ8NFY4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA6DQ8NFY4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA6DQ8NFY4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA6DQ8NFY4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA6DQ8NFY4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEMA6DQ8NFY4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA6DQ8NFY4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA6DQ8NFY4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEMA6DQ8NFY4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms