Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU1

BEST2, Bestrophin-2, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST2Q8NFU1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BEST2Q8NFU1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BEST2Q8NFU1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BEST2Q8NFU1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BEST2Q8NFU1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BEST2Q8NFU1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BEST2Q8NFU1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BEST2Q8NFU1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BEST2Q8NFU1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BEST2Q8NFU1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BEST2Q8NFU1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
BEST2Q8NFU1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BEST2Q8NFU1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BEST2Q8NFU1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BEST2Q8NFU1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BEST2Q8NFU1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BEST2Q8NFU1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BEST2Q8NFU1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BEST2Q8NFU1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BEST2Q8NFU1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BEST2Q8NFU1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BEST2Q8NFU1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
BEST2Q8NFU1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
BEST2Q8NFU1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
BEST2Q8NFU1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BEST2Q8NFU1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BEST2Q8NFU1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BEST2Q8NFU1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
BEST2Q8NFU1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BEST2Q8NFU1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
BEST2Q8NFU1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BEST2Q8NFU1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
BEST2Q8NFU1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
BEST2Q8NFU1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BEST2Q8NFU1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BEST2Q8NFU1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BEST2Q8NFU1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BEST2Q8NFU1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BEST2Q8NFU1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BEST2Q8NFU1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BEST2Q8NFU1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BEST2Q8NFU1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BEST2Q8NFU1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BEST2Q8NFU1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BEST2Q8NFU1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BEST2Q8NFU1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BEST2Q8NFU1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BEST2Q8NFU1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BEST2Q8NFU1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BEST2Q8NFU1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BEST2Q8NFU1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BEST2Q8NFU1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BEST2Q8NFU1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BEST2Q8NFU1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BEST2Q8NFU1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BEST2Q8NFU1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
BEST2Q8NFU1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
BEST2Q8NFU1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
BEST2Q8NFU1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BEST2Q8NFU1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BEST2Q8NFU1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BEST2Q8NFU1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
BEST2Q8NFU1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BEST2Q8NFU1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BEST2Q8NFU1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BEST2Q8NFU1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BEST2Q8NFU1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BEST2Q8NFU1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BEST2Q8NFU1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
BEST2Q8NFU1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BEST2Q8NFU1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BEST2Q8NFU1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
BEST2Q8NFU1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
BEST2Q8NFU1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BEST2Q8NFU1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
BEST2Q8NFU1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BEST2Q8NFU1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BEST2Q8NFU1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BEST2Q8NFU1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BEST2Q8NFU1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BEST2Q8NFU1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BEST2Q8NFU1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BEST2Q8NFU1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BEST2Q8NFU1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BEST2Q8NFU1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BEST2Q8NFU1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BEST2Q8NFU1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BEST2Q8NFU1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BEST2Q8NFU1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BEST2Q8NFU1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BEST2Q8NFU1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BEST2Q8NFU1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BEST2Q8NFU1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BEST2Q8NFU1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BEST2Q8NFU1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BEST2Q8NFU1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BEST2Q8NFU1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BEST2Q8NFU1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BEST2Q8NFU1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BEST2Q8NFU1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms