Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK8

FAM46D, Putative nucleotidyltransferase FAM46D, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46DQ8NEK8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM46DQ8NEK8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM46DQ8NEK8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM46DQ8NEK8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM46DQ8NEK8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM46DQ8NEK8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM46DQ8NEK8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM46DQ8NEK8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM46DQ8NEK8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM46DQ8NEK8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM46DQ8NEK8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM46DQ8NEK8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM46DQ8NEK8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM46DQ8NEK8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM46DQ8NEK8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM46DQ8NEK8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM46DQ8NEK8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM46DQ8NEK8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM46DQ8NEK8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM46DQ8NEK8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM46DQ8NEK8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM46DQ8NEK8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM46DQ8NEK8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM46DQ8NEK8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM46DQ8NEK8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM46DQ8NEK8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM46DQ8NEK8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM46DQ8NEK8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM46DQ8NEK8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM46DQ8NEK8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM46DQ8NEK8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM46DQ8NEK8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM46DQ8NEK8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM46DQ8NEK8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM46DQ8NEK8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM46DQ8NEK8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM46DQ8NEK8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM46DQ8NEK8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM46DQ8NEK8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM46DQ8NEK8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM46DQ8NEK8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM46DQ8NEK8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM46DQ8NEK8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM46DQ8NEK8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM46DQ8NEK8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM46DQ8NEK8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM46DQ8NEK8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM46DQ8NEK8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM46DQ8NEK8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM46DQ8NEK8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM46DQ8NEK8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM46DQ8NEK8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM46DQ8NEK8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM46DQ8NEK8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM46DQ8NEK8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM46DQ8NEK8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM46DQ8NEK8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM46DQ8NEK8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM46DQ8NEK8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM46DQ8NEK8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM46DQ8NEK8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM46DQ8NEK8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM46DQ8NEK8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM46DQ8NEK8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM46DQ8NEK8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM46DQ8NEK8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM46DQ8NEK8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM46DQ8NEK8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM46DQ8NEK8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM46DQ8NEK8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM46DQ8NEK8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM46DQ8NEK8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM46DQ8NEK8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM46DQ8NEK8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM46DQ8NEK8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM46DQ8NEK8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM46DQ8NEK8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM46DQ8NEK8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM46DQ8NEK8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM46DQ8NEK8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM46DQ8NEK8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM46DQ8NEK8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM46DQ8NEK8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM46DQ8NEK8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM46DQ8NEK8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM46DQ8NEK8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM46DQ8NEK8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM46DQ8NEK8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM46DQ8NEK8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM46DQ8NEK8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM46DQ8NEK8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM46DQ8NEK8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM46DQ8NEK8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM46DQ8NEK8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM46DQ8NEK8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM46DQ8NEK8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM46DQ8NEK8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM46DQ8NEK8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM46DQ8NEK8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM46DQ8NEK8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms