Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN5

PDPR, Pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPRQ8NCN5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDPRQ8NCN5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PDPRQ8NCN5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDPRQ8NCN5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDPRQ8NCN5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDPRQ8NCN5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDPRQ8NCN5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PDPRQ8NCN5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDPRQ8NCN5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDPRQ8NCN5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDPRQ8NCN5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDPRQ8NCN5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDPRQ8NCN5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDPRQ8NCN5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDPRQ8NCN5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDPRQ8NCN5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDPRQ8NCN5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDPRQ8NCN5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PDPRQ8NCN5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDPRQ8NCN5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDPRQ8NCN5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDPRQ8NCN5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDPRQ8NCN5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDPRQ8NCN5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDPRQ8NCN5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDPRQ8NCN5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDPRQ8NCN5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PDPRQ8NCN5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PDPRQ8NCN5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PDPRQ8NCN5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDPRQ8NCN5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDPRQ8NCN5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDPRQ8NCN5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDPRQ8NCN5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDPRQ8NCN5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDPRQ8NCN5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDPRQ8NCN5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDPRQ8NCN5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDPRQ8NCN5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PDPRQ8NCN5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDPRQ8NCN5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PDPRQ8NCN5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDPRQ8NCN5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDPRQ8NCN5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDPRQ8NCN5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDPRQ8NCN5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDPRQ8NCN5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDPRQ8NCN5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDPRQ8NCN5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDPRQ8NCN5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDPRQ8NCN5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDPRQ8NCN5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDPRQ8NCN5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDPRQ8NCN5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDPRQ8NCN5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDPRQ8NCN5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDPRQ8NCN5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDPRQ8NCN5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDPRQ8NCN5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDPRQ8NCN5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDPRQ8NCN5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDPRQ8NCN5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDPRQ8NCN5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDPRQ8NCN5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDPRQ8NCN5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDPRQ8NCN5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDPRQ8NCN5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDPRQ8NCN5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PDPRQ8NCN5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDPRQ8NCN5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDPRQ8NCN5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDPRQ8NCN5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDPRQ8NCN5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDPRQ8NCN5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDPRQ8NCN5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDPRQ8NCN5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDPRQ8NCN5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDPRQ8NCN5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDPRQ8NCN5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDPRQ8NCN5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDPRQ8NCN5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDPRQ8NCN5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDPRQ8NCN5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDPRQ8NCN5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDPRQ8NCN5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDPRQ8NCN5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDPRQ8NCN5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDPRQ8NCN5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDPRQ8NCN5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDPRQ8NCN5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDPRQ8NCN5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDPRQ8NCN5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDPRQ8NCN5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDPRQ8NCN5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDPRQ8NCN5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDPRQ8NCN5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PDPRQ8NCN5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PDPRQ8NCN5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDPRQ8NCN5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PDPRQ8NCN5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms