Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HJURPQ8NCD3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HJURPQ8NCD3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HJURPQ8NCD3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HJURPQ8NCD3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HJURPQ8NCD3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HJURPQ8NCD3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HJURPQ8NCD3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HJURPQ8NCD3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HJURPQ8NCD3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HJURPQ8NCD3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HJURPQ8NCD3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HJURPQ8NCD3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HJURPQ8NCD3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HJURPQ8NCD3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HJURPQ8NCD3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HJURPQ8NCD3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HJURPQ8NCD3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HJURPQ8NCD3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HJURPQ8NCD3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HJURPQ8NCD3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HJURPQ8NCD3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HJURPQ8NCD3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HJURPQ8NCD3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HJURPQ8NCD3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HJURPQ8NCD3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HJURPQ8NCD3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HJURPQ8NCD3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HJURPQ8NCD3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HJURPQ8NCD3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HJURPQ8NCD3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HJURPQ8NCD3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HJURPQ8NCD3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HJURPQ8NCD3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HJURPQ8NCD3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HJURPQ8NCD3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HJURPQ8NCD3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HJURPQ8NCD3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HJURPQ8NCD3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HJURPQ8NCD3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HJURPQ8NCD3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HJURPQ8NCD3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HJURPQ8NCD3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HJURPQ8NCD3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HJURPQ8NCD3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HJURPQ8NCD3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HJURPQ8NCD3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HJURPQ8NCD3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HJURPQ8NCD3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
HJURPQ8NCD3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HJURPQ8NCD3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HJURPQ8NCD3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HJURPQ8NCD3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HJURPQ8NCD3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HJURPQ8NCD3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HJURPQ8NCD3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HJURPQ8NCD3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HJURPQ8NCD3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HJURPQ8NCD3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HJURPQ8NCD3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HJURPQ8NCD3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HJURPQ8NCD3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HJURPQ8NCD3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HJURPQ8NCD3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HJURPQ8NCD3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HJURPQ8NCD3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HJURPQ8NCD3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HJURPQ8NCD3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
HJURPQ8NCD3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HJURPQ8NCD3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HJURPQ8NCD3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HJURPQ8NCD3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HJURPQ8NCD3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HJURPQ8NCD3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HJURPQ8NCD3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HJURPQ8NCD3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HJURPQ8NCD3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HJURPQ8NCD3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HJURPQ8NCD3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HJURPQ8NCD3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HJURPQ8NCD3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HJURPQ8NCD3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HJURPQ8NCD3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HJURPQ8NCD3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HJURPQ8NCD3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HJURPQ8NCD3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HJURPQ8NCD3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HJURPQ8NCD3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HJURPQ8NCD3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HJURPQ8NCD3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HJURPQ8NCD3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HJURPQ8NCD3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HJURPQ8NCD3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HJURPQ8NCD3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HJURPQ8NCD3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HJURPQ8NCD3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HJURPQ8NCD3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HJURPQ8NCD3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HJURPQ8NCD3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HJURPQ8NCD3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms