Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBE8

KLHL23, Kelch-like protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL23Q8NBE8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KLHL23Q8NBE8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KLHL23Q8NBE8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KLHL23Q8NBE8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KLHL23Q8NBE8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KLHL23Q8NBE8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KLHL23Q8NBE8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KLHL23Q8NBE8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KLHL23Q8NBE8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KLHL23Q8NBE8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
KLHL23Q8NBE8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KLHL23Q8NBE8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KLHL23Q8NBE8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KLHL23Q8NBE8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KLHL23Q8NBE8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
KLHL23Q8NBE8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KLHL23Q8NBE8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
KLHL23Q8NBE8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KLHL23Q8NBE8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHL23Q8NBE8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHL23Q8NBE8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
KLHL23Q8NBE8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KLHL23Q8NBE8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHL23Q8NBE8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHL23Q8NBE8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHL23Q8NBE8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHL23Q8NBE8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHL23Q8NBE8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHL23Q8NBE8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHL23Q8NBE8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHL23Q8NBE8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHL23Q8NBE8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHL23Q8NBE8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KLHL23Q8NBE8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KLHL23Q8NBE8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KLHL23Q8NBE8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KLHL23Q8NBE8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KLHL23Q8NBE8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHL23Q8NBE8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHL23Q8NBE8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHL23Q8NBE8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHL23Q8NBE8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHL23Q8NBE8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHL23Q8NBE8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KLHL23Q8NBE8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KLHL23Q8NBE8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KLHL23Q8NBE8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KLHL23Q8NBE8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
KLHL23Q8NBE8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
KLHL23Q8NBE8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
KLHL23Q8NBE8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KLHL23Q8NBE8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KLHL23Q8NBE8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KLHL23Q8NBE8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KLHL23Q8NBE8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KLHL23Q8NBE8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KLHL23Q8NBE8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KLHL23Q8NBE8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KLHL23Q8NBE8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KLHL23Q8NBE8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KLHL23Q8NBE8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KLHL23Q8NBE8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KLHL23Q8NBE8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KLHL23Q8NBE8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KLHL23Q8NBE8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KLHL23Q8NBE8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KLHL23Q8NBE8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KLHL23Q8NBE8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KLHL23Q8NBE8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
KLHL23Q8NBE8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KLHL23Q8NBE8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KLHL23Q8NBE8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KLHL23Q8NBE8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KLHL23Q8NBE8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KLHL23Q8NBE8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KLHL23Q8NBE8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KLHL23Q8NBE8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KLHL23Q8NBE8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KLHL23Q8NBE8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KLHL23Q8NBE8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KLHL23Q8NBE8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KLHL23Q8NBE8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KLHL23Q8NBE8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KLHL23Q8NBE8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KLHL23Q8NBE8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KLHL23Q8NBE8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KLHL23Q8NBE8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KLHL23Q8NBE8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KLHL23Q8NBE8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KLHL23Q8NBE8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KLHL23Q8NBE8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KLHL23Q8NBE8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KLHL23Q8NBE8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KLHL23Q8NBE8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
KLHL23Q8NBE8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KLHL23Q8NBE8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
KLHL23Q8NBE8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KLHL23Q8NBE8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KLHL23Q8NBE8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KLHL23Q8NBE8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms