Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U9

BMPER, BMP-binding endothelial regulator protein, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMPERQ8N8U9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BMPERQ8N8U9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BMPERQ8N8U9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BMPERQ8N8U9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BMPERQ8N8U9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BMPERQ8N8U9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BMPERQ8N8U9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BMPERQ8N8U9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BMPERQ8N8U9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BMPERQ8N8U9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BMPERQ8N8U9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BMPERQ8N8U9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BMPERQ8N8U9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BMPERQ8N8U9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BMPERQ8N8U9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BMPERQ8N8U9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BMPERQ8N8U9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BMPERQ8N8U9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BMPERQ8N8U9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BMPERQ8N8U9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BMPERQ8N8U9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BMPERQ8N8U9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BMPERQ8N8U9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BMPERQ8N8U9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BMPERQ8N8U9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BMPERQ8N8U9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BMPERQ8N8U9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
BMPERQ8N8U9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BMPERQ8N8U9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BMPERQ8N8U9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BMPERQ8N8U9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BMPERQ8N8U9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BMPERQ8N8U9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BMPERQ8N8U9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BMPERQ8N8U9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BMPERQ8N8U9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BMPERQ8N8U9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BMPERQ8N8U9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BMPERQ8N8U9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BMPERQ8N8U9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BMPERQ8N8U9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BMPERQ8N8U9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BMPERQ8N8U9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BMPERQ8N8U9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BMPERQ8N8U9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BMPERQ8N8U9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BMPERQ8N8U9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BMPERQ8N8U9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BMPERQ8N8U9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BMPERQ8N8U9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BMPERQ8N8U9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BMPERQ8N8U9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BMPERQ8N8U9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BMPERQ8N8U9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BMPERQ8N8U9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BMPERQ8N8U9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BMPERQ8N8U9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BMPERQ8N8U9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BMPERQ8N8U9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BMPERQ8N8U9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BMPERQ8N8U9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BMPERQ8N8U9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BMPERQ8N8U9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BMPERQ8N8U9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BMPERQ8N8U9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BMPERQ8N8U9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BMPERQ8N8U9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BMPERQ8N8U9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BMPERQ8N8U9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BMPERQ8N8U9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BMPERQ8N8U9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BMPERQ8N8U9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BMPERQ8N8U9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BMPERQ8N8U9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BMPERQ8N8U9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BMPERQ8N8U9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BMPERQ8N8U9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BMPERQ8N8U9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BMPERQ8N8U9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BMPERQ8N8U9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BMPERQ8N8U9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BMPERQ8N8U9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BMPERQ8N8U9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BMPERQ8N8U9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BMPERQ8N8U9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BMPERQ8N8U9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BMPERQ8N8U9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
BMPERQ8N8U9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BMPERQ8N8U9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BMPERQ8N8U9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BMPERQ8N8U9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BMPERQ8N8U9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BMPERQ8N8U9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BMPERQ8N8U9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BMPERQ8N8U9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BMPERQ8N8U9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BMPERQ8N8U9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BMPERQ8N8U9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BMPERQ8N8U9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BMPERQ8N8U9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms