Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7H5

PAF1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAF1Q8N7H5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PAF1Q8N7H5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PAF1Q8N7H5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PAF1Q8N7H5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PAF1Q8N7H5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PAF1Q8N7H5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PAF1Q8N7H5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PAF1Q8N7H5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PAF1Q8N7H5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PAF1Q8N7H5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PAF1Q8N7H5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PAF1Q8N7H5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PAF1Q8N7H5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PAF1Q8N7H5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PAF1Q8N7H5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PAF1Q8N7H5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PAF1Q8N7H5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PAF1Q8N7H5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PAF1Q8N7H5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PAF1Q8N7H5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PAF1Q8N7H5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PAF1Q8N7H5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PAF1Q8N7H5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAF1Q8N7H5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAF1Q8N7H5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAF1Q8N7H5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAF1Q8N7H5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAF1Q8N7H5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAF1Q8N7H5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PAF1Q8N7H5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAF1Q8N7H5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PAF1Q8N7H5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PAF1Q8N7H5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PAF1Q8N7H5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PAF1Q8N7H5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PAF1Q8N7H5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PAF1Q8N7H5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PAF1Q8N7H5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PAF1Q8N7H5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PAF1Q8N7H5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PAF1Q8N7H5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PAF1Q8N7H5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PAF1Q8N7H5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PAF1Q8N7H5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PAF1Q8N7H5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PAF1Q8N7H5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PAF1Q8N7H5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PAF1Q8N7H5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PAF1Q8N7H5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PAF1Q8N7H5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PAF1Q8N7H5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PAF1Q8N7H5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PAF1Q8N7H5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PAF1Q8N7H5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PAF1Q8N7H5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PAF1Q8N7H5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PAF1Q8N7H5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PAF1Q8N7H5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PAF1Q8N7H5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PAF1Q8N7H5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PAF1Q8N7H5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PAF1Q8N7H5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PAF1Q8N7H5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PAF1Q8N7H5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PAF1Q8N7H5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PAF1Q8N7H5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PAF1Q8N7H5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PAF1Q8N7H5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PAF1Q8N7H5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PAF1Q8N7H5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PAF1Q8N7H5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PAF1Q8N7H5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PAF1Q8N7H5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PAF1Q8N7H5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PAF1Q8N7H5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PAF1Q8N7H5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAF1Q8N7H5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAF1Q8N7H5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAF1Q8N7H5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PAF1Q8N7H5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAF1Q8N7H5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAF1Q8N7H5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PAF1Q8N7H5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PAF1Q8N7H5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PAF1Q8N7H5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PAF1Q8N7H5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PAF1Q8N7H5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PAF1Q8N7H5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PAF1Q8N7H5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PAF1Q8N7H5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PAF1Q8N7H5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PAF1Q8N7H5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PAF1Q8N7H5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PAF1Q8N7H5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PAF1Q8N7H5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PAF1Q8N7H5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PAF1Q8N7H5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PAF1Q8N7H5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PAF1Q8N7H5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PAF1Q8N7H5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms