Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC155Q8N6L0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC155Q8N6L0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC155Q8N6L0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC155Q8N6L0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC155Q8N6L0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC155Q8N6L0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC155Q8N6L0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC155Q8N6L0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC155Q8N6L0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC155Q8N6L0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC155Q8N6L0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC155Q8N6L0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC155Q8N6L0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC155Q8N6L0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC155Q8N6L0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC155Q8N6L0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC155Q8N6L0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC155Q8N6L0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC155Q8N6L0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC155Q8N6L0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC155Q8N6L0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC155Q8N6L0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC155Q8N6L0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC155Q8N6L0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC155Q8N6L0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC155Q8N6L0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC155Q8N6L0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC155Q8N6L0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC155Q8N6L0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC155Q8N6L0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC155Q8N6L0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC155Q8N6L0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC155Q8N6L0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC155Q8N6L0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC155Q8N6L0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC155Q8N6L0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC155Q8N6L0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC155Q8N6L0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC155Q8N6L0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC155Q8N6L0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC155Q8N6L0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC155Q8N6L0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC155Q8N6L0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC155Q8N6L0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC155Q8N6L0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC155Q8N6L0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC155Q8N6L0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC155Q8N6L0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC155Q8N6L0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC155Q8N6L0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC155Q8N6L0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC155Q8N6L0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC155Q8N6L0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC155Q8N6L0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC155Q8N6L0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC155Q8N6L0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC155Q8N6L0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC155Q8N6L0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC155Q8N6L0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC155Q8N6L0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC155Q8N6L0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC155Q8N6L0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC155Q8N6L0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC155Q8N6L0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC155Q8N6L0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC155Q8N6L0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC155Q8N6L0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC155Q8N6L0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC155Q8N6L0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC155Q8N6L0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC155Q8N6L0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC155Q8N6L0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC155Q8N6L0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC155Q8N6L0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC155Q8N6L0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC155Q8N6L0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC155Q8N6L0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC155Q8N6L0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC155Q8N6L0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC155Q8N6L0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC155Q8N6L0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC155Q8N6L0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC155Q8N6L0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC155Q8N6L0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC155Q8N6L0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC155Q8N6L0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC155Q8N6L0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC155Q8N6L0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC155Q8N6L0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC155Q8N6L0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC155Q8N6L0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC155Q8N6L0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC155Q8N6L0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC155Q8N6L0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC155Q8N6L0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC155Q8N6L0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC155Q8N6L0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC155Q8N6L0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC155Q8N6L0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms