Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G5

CSGALNACT2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSGALNACT2Q8N6G5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CSGALNACT2Q8N6G5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSGALNACT2Q8N6G5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSGALNACT2Q8N6G5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSGALNACT2Q8N6G5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSGALNACT2Q8N6G5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSGALNACT2Q8N6G5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSGALNACT2Q8N6G5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CSGALNACT2Q8N6G5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CSGALNACT2Q8N6G5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CSGALNACT2Q8N6G5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CSGALNACT2Q8N6G5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CSGALNACT2Q8N6G5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CSGALNACT2Q8N6G5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CSGALNACT2Q8N6G5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CSGALNACT2Q8N6G5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CSGALNACT2Q8N6G5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CSGALNACT2Q8N6G5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CSGALNACT2Q8N6G5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CSGALNACT2Q8N6G5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CSGALNACT2Q8N6G5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CSGALNACT2Q8N6G5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CSGALNACT2Q8N6G5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CSGALNACT2Q8N6G5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CSGALNACT2Q8N6G5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CSGALNACT2Q8N6G5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CSGALNACT2Q8N6G5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CSGALNACT2Q8N6G5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CSGALNACT2Q8N6G5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CSGALNACT2Q8N6G5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CSGALNACT2Q8N6G5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CSGALNACT2Q8N6G5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CSGALNACT2Q8N6G5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CSGALNACT2Q8N6G5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CSGALNACT2Q8N6G5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CSGALNACT2Q8N6G5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CSGALNACT2Q8N6G5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CSGALNACT2Q8N6G5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CSGALNACT2Q8N6G5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CSGALNACT2Q8N6G5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CSGALNACT2Q8N6G5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CSGALNACT2Q8N6G5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CSGALNACT2Q8N6G5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CSGALNACT2Q8N6G5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CSGALNACT2Q8N6G5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CSGALNACT2Q8N6G5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CSGALNACT2Q8N6G5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CSGALNACT2Q8N6G5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CSGALNACT2Q8N6G5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CSGALNACT2Q8N6G5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CSGALNACT2Q8N6G5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CSGALNACT2Q8N6G5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CSGALNACT2Q8N6G5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CSGALNACT2Q8N6G5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CSGALNACT2Q8N6G5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSGALNACT2Q8N6G5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSGALNACT2Q8N6G5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSGALNACT2Q8N6G5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSGALNACT2Q8N6G5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSGALNACT2Q8N6G5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSGALNACT2Q8N6G5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSGALNACT2Q8N6G5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSGALNACT2Q8N6G5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSGALNACT2Q8N6G5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSGALNACT2Q8N6G5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSGALNACT2Q8N6G5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CSGALNACT2Q8N6G5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSGALNACT2Q8N6G5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSGALNACT2Q8N6G5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSGALNACT2Q8N6G5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSGALNACT2Q8N6G5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSGALNACT2Q8N6G5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CSGALNACT2Q8N6G5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CSGALNACT2Q8N6G5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CSGALNACT2Q8N6G5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CSGALNACT2Q8N6G5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CSGALNACT2Q8N6G5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CSGALNACT2Q8N6G5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CSGALNACT2Q8N6G5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CSGALNACT2Q8N6G5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CSGALNACT2Q8N6G5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CSGALNACT2Q8N6G5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CSGALNACT2Q8N6G5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CSGALNACT2Q8N6G5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CSGALNACT2Q8N6G5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CSGALNACT2Q8N6G5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CSGALNACT2Q8N6G5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CSGALNACT2Q8N6G5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CSGALNACT2Q8N6G5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CSGALNACT2Q8N6G5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSGALNACT2Q8N6G5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSGALNACT2Q8N6G5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSGALNACT2Q8N6G5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSGALNACT2Q8N6G5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CSGALNACT2Q8N6G5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms