Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J5

PPM1K, Protein phosphatase 1K, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1KQ8N3J5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PPM1KQ8N3J5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PPM1KQ8N3J5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPM1KQ8N3J5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPM1KQ8N3J5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPM1KQ8N3J5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPM1KQ8N3J5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPM1KQ8N3J5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PPM1KQ8N3J5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPM1KQ8N3J5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPM1KQ8N3J5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPM1KQ8N3J5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPM1KQ8N3J5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPM1KQ8N3J5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPM1KQ8N3J5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPM1KQ8N3J5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPM1KQ8N3J5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PPM1KQ8N3J5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PPM1KQ8N3J5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PPM1KQ8N3J5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPM1KQ8N3J5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPM1KQ8N3J5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPM1KQ8N3J5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPM1KQ8N3J5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPM1KQ8N3J5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PPM1KQ8N3J5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PPM1KQ8N3J5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PPM1KQ8N3J5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PPM1KQ8N3J5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PPM1KQ8N3J5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PPM1KQ8N3J5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PPM1KQ8N3J5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PPM1KQ8N3J5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PPM1KQ8N3J5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PPM1KQ8N3J5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPM1KQ8N3J5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PPM1KQ8N3J5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPM1KQ8N3J5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPM1KQ8N3J5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPM1KQ8N3J5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PPM1KQ8N3J5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PPM1KQ8N3J5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PPM1KQ8N3J5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPM1KQ8N3J5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPM1KQ8N3J5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPM1KQ8N3J5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPM1KQ8N3J5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPM1KQ8N3J5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPM1KQ8N3J5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPM1KQ8N3J5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPM1KQ8N3J5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPM1KQ8N3J5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPM1KQ8N3J5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPM1KQ8N3J5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPM1KQ8N3J5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPM1KQ8N3J5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPM1KQ8N3J5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPM1KQ8N3J5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPM1KQ8N3J5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PPM1KQ8N3J5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPM1KQ8N3J5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPM1KQ8N3J5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PPM1KQ8N3J5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPM1KQ8N3J5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPM1KQ8N3J5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPM1KQ8N3J5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPM1KQ8N3J5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPM1KQ8N3J5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPM1KQ8N3J5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPM1KQ8N3J5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPM1KQ8N3J5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPM1KQ8N3J5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPM1KQ8N3J5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPM1KQ8N3J5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPM1KQ8N3J5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PPM1KQ8N3J5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPM1KQ8N3J5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPM1KQ8N3J5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPM1KQ8N3J5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPM1KQ8N3J5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPM1KQ8N3J5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPM1KQ8N3J5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPM1KQ8N3J5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPM1KQ8N3J5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPM1KQ8N3J5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPM1KQ8N3J5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPM1KQ8N3J5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PPM1KQ8N3J5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPM1KQ8N3J5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPM1KQ8N3J5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPM1KQ8N3J5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PPM1KQ8N3J5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPM1KQ8N3J5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPM1KQ8N3J5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PPM1KQ8N3J5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPM1KQ8N3J5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PPM1KQ8N3J5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PPM1KQ8N3J5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PPM1KQ8N3J5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PPM1KQ8N3J5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms