Protein–RNA interactions for Protein: Q8N323

NXPE1, NXPE family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE1Q8N323 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NXPE1Q8N323 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NXPE1Q8N323 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
NXPE1Q8N323 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NXPE1Q8N323 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NXPE1Q8N323 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NXPE1Q8N323 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NXPE1Q8N323 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NXPE1Q8N323 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NXPE1Q8N323 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NXPE1Q8N323 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NXPE1Q8N323 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NXPE1Q8N323 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NXPE1Q8N323 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NXPE1Q8N323 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NXPE1Q8N323 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NXPE1Q8N323 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NXPE1Q8N323 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NXPE1Q8N323 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NXPE1Q8N323 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NXPE1Q8N323 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NXPE1Q8N323 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NXPE1Q8N323 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NXPE1Q8N323 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NXPE1Q8N323 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NXPE1Q8N323 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NXPE1Q8N323 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NXPE1Q8N323 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NXPE1Q8N323 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NXPE1Q8N323 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NXPE1Q8N323 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NXPE1Q8N323 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NXPE1Q8N323 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NXPE1Q8N323 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NXPE1Q8N323 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NXPE1Q8N323 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NXPE1Q8N323 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NXPE1Q8N323 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NXPE1Q8N323 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NXPE1Q8N323 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NXPE1Q8N323 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NXPE1Q8N323 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NXPE1Q8N323 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NXPE1Q8N323 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NXPE1Q8N323 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NXPE1Q8N323 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NXPE1Q8N323 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NXPE1Q8N323 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NXPE1Q8N323 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NXPE1Q8N323 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NXPE1Q8N323 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NXPE1Q8N323 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NXPE1Q8N323 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NXPE1Q8N323 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NXPE1Q8N323 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NXPE1Q8N323 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NXPE1Q8N323 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NXPE1Q8N323 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NXPE1Q8N323 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NXPE1Q8N323 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NXPE1Q8N323 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NXPE1Q8N323 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NXPE1Q8N323 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NXPE1Q8N323 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NXPE1Q8N323 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NXPE1Q8N323 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NXPE1Q8N323 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NXPE1Q8N323 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NXPE1Q8N323 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NXPE1Q8N323 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NXPE1Q8N323 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NXPE1Q8N323 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NXPE1Q8N323 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NXPE1Q8N323 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NXPE1Q8N323 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NXPE1Q8N323 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NXPE1Q8N323 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NXPE1Q8N323 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NXPE1Q8N323 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NXPE1Q8N323 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NXPE1Q8N323 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NXPE1Q8N323 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NXPE1Q8N323 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NXPE1Q8N323 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NXPE1Q8N323 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NXPE1Q8N323 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NXPE1Q8N323 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NXPE1Q8N323 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NXPE1Q8N323 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NXPE1Q8N323 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NXPE1Q8N323 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NXPE1Q8N323 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NXPE1Q8N323 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NXPE1Q8N323 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NXPE1Q8N323 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NXPE1Q8N323 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NXPE1Q8N323 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NXPE1Q8N323 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NXPE1Q8N323 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NXPE1Q8N323 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.1 ms