Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZS8

CACNA2D3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3Q8IZS8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNA2D3Q8IZS8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNA2D3Q8IZS8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNA2D3Q8IZS8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNA2D3Q8IZS8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNA2D3Q8IZS8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNA2D3Q8IZS8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNA2D3Q8IZS8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNA2D3Q8IZS8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNA2D3Q8IZS8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CACNA2D3Q8IZS8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CACNA2D3Q8IZS8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CACNA2D3Q8IZS8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CACNA2D3Q8IZS8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CACNA2D3Q8IZS8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNA2D3Q8IZS8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNA2D3Q8IZS8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNA2D3Q8IZS8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNA2D3Q8IZS8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNA2D3Q8IZS8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNA2D3Q8IZS8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNA2D3Q8IZS8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNA2D3Q8IZS8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNA2D3Q8IZS8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNA2D3Q8IZS8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNA2D3Q8IZS8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNA2D3Q8IZS8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNA2D3Q8IZS8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNA2D3Q8IZS8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNA2D3Q8IZS8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNA2D3Q8IZS8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNA2D3Q8IZS8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNA2D3Q8IZS8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNA2D3Q8IZS8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNA2D3Q8IZS8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNA2D3Q8IZS8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNA2D3Q8IZS8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CACNA2D3Q8IZS8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNA2D3Q8IZS8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNA2D3Q8IZS8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNA2D3Q8IZS8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNA2D3Q8IZS8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNA2D3Q8IZS8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNA2D3Q8IZS8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNA2D3Q8IZS8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNA2D3Q8IZS8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNA2D3Q8IZS8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNA2D3Q8IZS8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNA2D3Q8IZS8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNA2D3Q8IZS8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNA2D3Q8IZS8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNA2D3Q8IZS8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNA2D3Q8IZS8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNA2D3Q8IZS8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNA2D3Q8IZS8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNA2D3Q8IZS8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNA2D3Q8IZS8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNA2D3Q8IZS8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNA2D3Q8IZS8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNA2D3Q8IZS8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNA2D3Q8IZS8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNA2D3Q8IZS8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNA2D3Q8IZS8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNA2D3Q8IZS8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNA2D3Q8IZS8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNA2D3Q8IZS8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNA2D3Q8IZS8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNA2D3Q8IZS8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNA2D3Q8IZS8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNA2D3Q8IZS8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNA2D3Q8IZS8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CACNA2D3Q8IZS8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CACNA2D3Q8IZS8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CACNA2D3Q8IZS8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNA2D3Q8IZS8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNA2D3Q8IZS8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNA2D3Q8IZS8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNA2D3Q8IZS8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNA2D3Q8IZS8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNA2D3Q8IZS8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNA2D3Q8IZS8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNA2D3Q8IZS8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNA2D3Q8IZS8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNA2D3Q8IZS8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNA2D3Q8IZS8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNA2D3Q8IZS8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNA2D3Q8IZS8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNA2D3Q8IZS8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNA2D3Q8IZS8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNA2D3Q8IZS8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNA2D3Q8IZS8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNA2D3Q8IZS8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNA2D3Q8IZS8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNA2D3Q8IZS8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNA2D3Q8IZS8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNA2D3Q8IZS8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNA2D3Q8IZS8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNA2D3Q8IZS8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNA2D3Q8IZS8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNA2D3Q8IZS8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms