Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWT1

SCN4B, Sodium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4BQ8IWT1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCN4BQ8IWT1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCN4BQ8IWT1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SCN4BQ8IWT1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCN4BQ8IWT1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCN4BQ8IWT1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SCN4BQ8IWT1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SCN4BQ8IWT1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
SCN4BQ8IWT1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCN4BQ8IWT1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCN4BQ8IWT1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCN4BQ8IWT1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCN4BQ8IWT1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCN4BQ8IWT1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCN4BQ8IWT1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCN4BQ8IWT1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCN4BQ8IWT1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SCN4BQ8IWT1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCN4BQ8IWT1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCN4BQ8IWT1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCN4BQ8IWT1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCN4BQ8IWT1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCN4BQ8IWT1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCN4BQ8IWT1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SCN4BQ8IWT1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCN4BQ8IWT1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCN4BQ8IWT1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCN4BQ8IWT1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCN4BQ8IWT1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCN4BQ8IWT1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCN4BQ8IWT1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCN4BQ8IWT1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCN4BQ8IWT1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCN4BQ8IWT1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCN4BQ8IWT1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SCN4BQ8IWT1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCN4BQ8IWT1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCN4BQ8IWT1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCN4BQ8IWT1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCN4BQ8IWT1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCN4BQ8IWT1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCN4BQ8IWT1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SCN4BQ8IWT1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SCN4BQ8IWT1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCN4BQ8IWT1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCN4BQ8IWT1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SCN4BQ8IWT1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SCN4BQ8IWT1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCN4BQ8IWT1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCN4BQ8IWT1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCN4BQ8IWT1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCN4BQ8IWT1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCN4BQ8IWT1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCN4BQ8IWT1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCN4BQ8IWT1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SCN4BQ8IWT1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SCN4BQ8IWT1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCN4BQ8IWT1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCN4BQ8IWT1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCN4BQ8IWT1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCN4BQ8IWT1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCN4BQ8IWT1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCN4BQ8IWT1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SCN4BQ8IWT1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCN4BQ8IWT1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCN4BQ8IWT1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCN4BQ8IWT1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCN4BQ8IWT1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCN4BQ8IWT1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCN4BQ8IWT1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCN4BQ8IWT1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCN4BQ8IWT1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCN4BQ8IWT1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCN4BQ8IWT1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCN4BQ8IWT1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCN4BQ8IWT1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCN4BQ8IWT1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCN4BQ8IWT1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCN4BQ8IWT1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCN4BQ8IWT1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCN4BQ8IWT1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCN4BQ8IWT1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCN4BQ8IWT1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCN4BQ8IWT1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCN4BQ8IWT1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCN4BQ8IWT1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCN4BQ8IWT1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCN4BQ8IWT1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCN4BQ8IWT1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCN4BQ8IWT1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCN4BQ8IWT1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCN4BQ8IWT1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCN4BQ8IWT1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SCN4BQ8IWT1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCN4BQ8IWT1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCN4BQ8IWT1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCN4BQ8IWT1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCN4BQ8IWT1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN4BQ8IWT1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN4BQ8IWT1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms