Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVT2

MISP, Mitotic interactor and substrate of PLK1, humanhuman

Predictions only

Length 679 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MISPQ8IVT2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MISPQ8IVT2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MISPQ8IVT2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MISPQ8IVT2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MISPQ8IVT2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MISPQ8IVT2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MISPQ8IVT2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MISPQ8IVT2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MISPQ8IVT2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MISPQ8IVT2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MISPQ8IVT2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MISPQ8IVT2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MISPQ8IVT2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MISPQ8IVT2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MISPQ8IVT2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MISPQ8IVT2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MISPQ8IVT2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MISPQ8IVT2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MISPQ8IVT2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MISPQ8IVT2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MISPQ8IVT2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MISPQ8IVT2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MISPQ8IVT2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MISPQ8IVT2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MISPQ8IVT2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MISPQ8IVT2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MISPQ8IVT2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MISPQ8IVT2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MISPQ8IVT2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MISPQ8IVT2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MISPQ8IVT2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MISPQ8IVT2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MISPQ8IVT2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MISPQ8IVT2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MISPQ8IVT2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MISPQ8IVT2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MISPQ8IVT2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MISPQ8IVT2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MISPQ8IVT2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MISPQ8IVT2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MISPQ8IVT2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MISPQ8IVT2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MISPQ8IVT2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MISPQ8IVT2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MISPQ8IVT2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MISPQ8IVT2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MISPQ8IVT2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MISPQ8IVT2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MISPQ8IVT2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MISPQ8IVT2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MISPQ8IVT2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MISPQ8IVT2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MISPQ8IVT2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MISPQ8IVT2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MISPQ8IVT2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MISPQ8IVT2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MISPQ8IVT2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MISPQ8IVT2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MISPQ8IVT2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MISPQ8IVT2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MISPQ8IVT2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MISPQ8IVT2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MISPQ8IVT2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MISPQ8IVT2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MISPQ8IVT2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MISPQ8IVT2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MISPQ8IVT2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MISPQ8IVT2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MISPQ8IVT2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MISPQ8IVT2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MISPQ8IVT2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MISPQ8IVT2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MISPQ8IVT2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MISPQ8IVT2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MISPQ8IVT2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MISPQ8IVT2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MISPQ8IVT2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MISPQ8IVT2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MISPQ8IVT2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MISPQ8IVT2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MISPQ8IVT2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MISPQ8IVT2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MISPQ8IVT2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MISPQ8IVT2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MISPQ8IVT2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MISPQ8IVT2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MISPQ8IVT2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MISPQ8IVT2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MISPQ8IVT2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MISPQ8IVT2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MISPQ8IVT2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MISPQ8IVT2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MISPQ8IVT2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MISPQ8IVT2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MISPQ8IVT2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MISPQ8IVT2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MISPQ8IVT2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MISPQ8IVT2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MISPQ8IVT2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MISPQ8IVT2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms